24小时热门版块排行榜    

查看: 863  |  回复: 3

voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 有没有能够改变蛋白质分子总体构型的软件 已有1人参与

比如我有一个直链形的蛋白质,想把它在视觉效果上弄弯,这个有软件能够操作吗?
如果一点一点的改构型会比较麻烦,因为蛋白质构型很大,不好操作
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
voleyes: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-26 11:46:58
这个简单,在主链某个位置转一个二面角(PHI或PSI),后面的所有原子都转一下,需要的话我给你一个二面角转的子程序,外加一个循环就行了。
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
2楼2014-09-24 20:42:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by polypro at 2014-09-24 20:42:16
这个简单,在主链某个位置转一个二面角(PHI或PSI),后面的所有原子都转一下,需要的话我给你一个二面角转的子程序,外加一个循环就行了。

谢谢,程序能否发给我  okakasdu@126.com
3楼2014-09-26 11:49:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by voleyes at 2014-09-26 11:49:27
谢谢,程序能否发给我  okakasdu@126.com...

!!rotate atoms from iatom0 to iatom1     
do i=iatom0,iatom1   
        x=xx(i)
        y=yy(i)
        z=zz(i)
        call rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,angg)  !C
        xx(i)=x
        yy(i)=y
        zz(i)=z        
     enddo
  subroutine rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an) !rotate (x,y,z) with origin (ax,ay,az) around axis (xi,yi,zi) with angle an
    implicit none
    real x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an
    real r,r12,r23,r13,rcor
    real xr,yr,zr
    real x0,y0,z0    !!only use in test
    integer i,j,k
r=sqrt(xi*xi+yi*yi+zi*zi)
if(r<0.1)goto 101
x0=x
y0=y
x0=z
xi=xi/r
yi=yi/r
zi=zi/r
r12=xi*xi+yi*yi
r23=yi*yi+zi*zi
r13=xi*xi+zi*zi
rcor=xi*x+yi*y+zi*z
xr=ax*r23+xi*(-ay*yi-az*zi+rcor)+((x-ax)*r23+xi*(ay*yi+az*zi-yi*y-zi*z))*cos(an)+(ay*zi-az*yi-zi*y+yi*z)*sin(an)
yr=ay*r13+yi*(-ax*xi-az*zi+rcor)+((y-ay)*r13+yi*(ax*xi+az*zi-xi*x-zi*z))*cos(an)+(-ax*zi+az*xi+zi*x-xi*z)*sin(an)
zr=az*r12+zi*(-ax*xi-ay*yi+rcor)+((z-az)*r12+zi*(ax*xi+ay*yi-xi*x-yi*y))*cos(an)+(ax*yi-ay*xi-yi*x+xi*y)*sin(an)
x=xr
y=yr
z=zr
!if(abs(x)+abs(y)+abs(z)<0.001)then
!   print*,"warning",xi,yi,zi,r,x,y,z,an,x0,y0,z0
!endif
101 continue
  end subroutine rotate_matrix2
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
4楼2014-09-27 21:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 voleyes 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华南理工大学材料与化工326分,求调剂 +3 wujinrui1 2026-02-28 3/150 2026-03-02 16:36 by chuocheng
[考研] 清华大学 材料与化工 353分求调剂 +3 awaystay 2026-03-02 4/200 2026-03-02 16:35 by chuocheng
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +12 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 12/600 2026-03-02 16:18 by youmomaoyan
[考研] 求调剂 +9 yunziaaaaa 2026-03-01 10/500 2026-03-02 15:18 by 半截的诗0927
[考研] 289求调剂 +4 yang婷 2026-03-02 4/200 2026-03-02 14:31 by 向上的胖东
[考研] 290分材料工程085601求调剂 数二英一 +3 llx0610 2026-03-02 3/150 2026-03-02 14:15 by yc258
[考研] 282求调剂 +4 2103240126 2026-03-02 5/250 2026-03-02 13:45 by littlehu66
[考博] 诚招农业博士 +3 心欣向荣 2026-02-28 3/150 2026-03-02 13:33 by 时间不狗
[考研] 材料学硕318求调剂 +9 February_Feb 2026-03-01 9/450 2026-03-02 13:31 by njzyff
[考研] 0805总分292,求调剂 +8 幻想之殇 2026-03-01 8/400 2026-03-02 12:51 by 无际的草原
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 9/450 2026-03-02 12:04 by 52hz~~
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+4 ,!? 2026-03-02 6/300 2026-03-02 11:07 by 黑!在干嘛
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +6 kyf化工 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:56 by 无际的草原
[考研] 264求调剂 +4 巴拉巴拉根556 2026-02-28 4/200 2026-03-02 10:48 by yuchj
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博!
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见