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voleyes银虫 (正式写手)
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有没有能够改变蛋白质分子总体构型的软件 已有1人参与
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比如我有一个直链形的蛋白质，想把它在视觉效果上弄弯，这个有软件能够操作吗？ 如果一点一点的改构型会比较麻烦，因为蛋白质构型很大，不好操作 |
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2楼2014-09-24 20:42:16
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!!rotate atoms from iatom0 to iatom1 do i=iatom0,iatom1 x=xx(i) y=yy(i) z=zz(i) call rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,angg) !C xx(i)=x yy(i)=y zz(i)=z enddo subroutine rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an) !rotate (x,y,z) with origin (ax,ay,az) around axis (xi,yi,zi) with angle an implicit none real x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an real r,r12,r23,r13,rcor real xr,yr,zr real x0,y0,z0 !!only use in test integer i,j,k r=sqrt(xi*xi+yi*yi+zi*zi) if(r<0.1)goto 101 x0=x y0=y x0=z xi=xi/r yi=yi/r zi=zi/r r12=xi*xi+yi*yi r23=yi*yi+zi*zi r13=xi*xi+zi*zi rcor=xi*x+yi*y+zi*z xr=ax*r23+xi*(-ay*yi-az*zi+rcor)+((x-ax)*r23+xi*(ay*yi+az*zi-yi*y-zi*z))*cos(an)+(ay*zi-az*yi-zi*y+yi*z)*sin(an) yr=ay*r13+yi*(-ax*xi-az*zi+rcor)+((y-ay)*r13+yi*(ax*xi+az*zi-xi*x-zi*z))*cos(an)+(-ax*zi+az*xi+zi*x-xi*z)*sin(an) zr=az*r12+zi*(-ax*xi-ay*yi+rcor)+((z-az)*r12+zi*(ax*xi+ay*yi-xi*x-yi*y))*cos(an)+(ax*yi-ay*xi-yi*x+xi*y)*sin(an) x=xr y=yr z=zr !if(abs(x)+abs(y)+abs(z)<0.001)then ! print*,"warning",xi,yi,zi,r,x,y,z,an,x0,y0,z0 !endif 101 continue end subroutine rotate_matrix2 |
4楼2014-09-27 21:07:41