24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2968  |  回复: 6

mxbn55

金虫 (小有名气)

[求助] MS discover时,分子跑到盒子外面了 已有4人参与

我在做水的扩散系数的分子模拟,可是水分子都跑到盒子外面了,这样对最后计算的扩散系数有影响吗?跑到外面是正确的吗?
求各位大神帮助
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

动力学模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mxbn55: 金币+10, 谢谢 2014-09-14 18:04:27
因为采取了周期性,有分子跑出去必有同样的分子跑进来,分子总数和种类是保持不变的,只是显示方式的问题,你改一下显示方式(dispaly style)就可以,改成
in cell 或者 defalt,多点点试试
2楼2014-09-04 10:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
周期性边界条件,对结果无影响。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2014-09-04 13:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wildhoney

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mxbn55: 金币+10, 谢谢 2014-09-14 18:04:18
该现象是使用PBC周期性处理时显示方式差异造成,对计算结果没有影响,你可以在Display Style | Lattice | Display Style中更改为 In Cell来保持所有粒子都在晶胞中。同时,如果需要在整个轨迹播放过程中都保持所有粒子位于晶胞中,还需在上述操作的基础上,勾选Animation Options中的Recalculate atom visibility every frame。
4楼2014-09-08 09:50:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南楚狂人

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

肯定会有影响,建议楼主重做。尽量消除无关变量的影响。

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-09-08 10:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxbn55

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-09-04 13:33:48
周期性边界条件,对结果无影响。

你好,我已经设置了周期性边界条件,那就是说分子跑不跑到外面对结果没影响,那在模拟的过程中密度是否发生了改变?谢谢
6楼2014-09-09 09:49:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxbn55

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-09-04 10:07:59
因为采取了周期性,有分子跑出去必有同样的分子跑进来,分子总数和种类是保持不变的,只是显示方式的问题,你改一下显示方式(dispaly style)就可以,改成
in cell 或者 defalt,多点点试试

可是默认的就是defalt,无论是defalt或者incell,好像没什么变化啊?
7楼2014-09-09 09:50:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mxbn55 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本科南方医科大学 一志愿985 药学学硕284分 求调剂 +5 弱水听文 2026-04-09 5/250 2026-04-12 13:16 by shengxi123
[找工作] 山东高校教师考核超级无底线,员工过不下去啦 +4 qut2026 2026-04-09 9/450 2026-04-12 00:54 by qut2026
[考研] 材料工程日语考生求调剂 +7 0856?调剂 2026-04-10 7/350 2026-04-11 21:33 by 蓝云思雨
[考研] 295求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-05 7/350 2026-04-11 19:02 by laoshidan
[考研] 求调剂,一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
[考研] 269电子信息求调剂,可转专业 +11 独酌wl 2026-04-06 11/550 2026-04-11 11:12 by 逆水乘风
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 080500求调剂 +17 黄宇博 2026-04-06 17/850 2026-04-11 08:36 by zhq0425
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +22 土豆er? 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 10:58 by 高维春
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 初试分332,一志愿报考西北工业大学, +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 材料调剂 +14 一样YWY 2026-04-06 14/700 2026-04-08 23:00 by 猪会飞
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 085100建筑学 寻求跨专业调剂 一志愿南大294分 校级省级国家级奖项若干 踏实肯干 +3 1021075758 2026-04-06 4/200 2026-04-07 09:23 by 蓝云思雨
[考研] 材料调剂 +5 小刘同学吖吖 2026-04-06 5/250 2026-04-06 18:34 by sherry_1901
[考研] 22408 331分求调剂 +4 y__1 2026-04-06 4/200 2026-04-06 17:26 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见