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小木虫zb

木虫 (正式写手)

[求助] MS模拟中怎么选取多个分子

MS模拟计算辛烷分子在PVC膜中的扩散系数,一条PVC链,100个辛烷分子,分子体系创建后,优化,然后要选取100个辛烷分子并标记,以便后面的分析,本人刚接触MS,只会选取一个辛烷分子,不知道有没有什么方便的方法选取100个辛烷分子?
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liuqiang2270

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-03-18 20:19:19
先选择这条链的一个园子,然后右键 选择fragment就能选择整条链了。
2楼2013-03-18 20:06:21
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小木虫zb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuqiang2270 at 2013-03-18 20:06:21
先选择这条链的一个园子,然后右键 选择fragment就能选择整条链了。

选择一个辛烷分子是用这种方式,但共有100个辛烷分子,所有的都要选,就不知道该怎么选了
3楼2013-03-18 20:16:31
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小木虫zb: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-19 11:56:02
先用Forcite中的任意一个力场assign一下。PVC中的C与辛烷中的C(假设为C3)应该是不同的力场。即便是一样的,也可以参照2楼的方法,将PVC链上的C原子的力场类型改成不一样的(右边的properties explorer中可改)
然后用edit菜单的原子选择工具,选择力场类型C3的原子,这样可以把所有辛烷中的C选中,剩下的参照2楼
4楼2013-03-19 09:11:42
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

当年做晶体生长的时候曾经试过将原子设置为hide,你可以试试把PVC长链hide,框选剩下的辛烷分子,标记颜色什么的
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2013-03-19 14:11:16
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

回去我再试试看 很久没碰了 忘记了
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2013-03-19 14:13:07
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小木虫zb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2013-03-19 14:13:07
回去我再试试看 很久没碰了 忘记了

已经按4楼的方法解决了,不过也谢谢你

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2013-03-19 15:23:18
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