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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS模拟中怎么选取多个分子
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小木虫zb

木虫 (正式写手)

[求助] MS模拟中怎么选取多个分子

MS模拟计算辛烷分子在PVC膜中的扩散系数，一条PVC链，100个辛烷分子，分子体系创建后，优化，然后要选取100个辛烷分子并标记，以便后面的分析，本人刚接触MS，只会选取一个辛烷分子，不知道有没有什么方便的方法选取100个辛烷分子？
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1楼 2013-03-18 19:27:42
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小木虫zb: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-19 11:56:02
先用Forcite中的任意一个力场assign一下。PVC中的C与辛烷中的C（假设为C3）应该是不同的力场。即便是一样的，也可以参照2楼的方法，将PVC链上的C原子的力场类型改成不一样的（右边的properties explorer中可改）
然后用edit菜单的原子选择工具，选择力场类型C3的原子，这样可以把所有辛烷中的C选中，剩下的参照2楼
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4楼2013-03-19 09:11:42
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liuqiang2270

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-03-18 20:19:19
先选择这条链的一个园子，然后右键 选择fragment就能选择整条链了。
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2楼2013-03-18 20:06:21
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小木虫zb

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuqiang2270 at 2013-03-18 20:06:21
先选择这条链的一个园子，然后右键 选择fragment就能选择整条链了。

选择一个辛烷分子是用这种方式，但共有100个辛烷分子，所有的都要选，就不知道该怎么选了
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3楼2013-03-18 20:16:31
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
当年做晶体生长的时候曾经试过将原子设置为hide，你可以试试把PVC长链hide，框选剩下的辛烷分子，标记颜色什么的
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2013-03-19 14:11:16
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