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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】MS中动力学之后水分子个数问题 已有5人参与

我在MS中建立一个盒子,然后加上100个水还有一些其他的分子,那跑完动力学之后水分子个数会发生变化吗?谢谢~~~
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)


xiaohunhun(金币+1):谢谢 2010-04-27 11:46
我不知道水分子跑到盒子外面 算不算个数发生变化   水分子的总数不会发生变化的呀
2楼2010-04-27 11:12:56
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zzy870720z

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xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-27 20:15
MD应该对原子的位置有约定才对,可以阻止整体的移动,分子的总数应该不发生变化
博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2010-04-27 12:48:00
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睡觉的猫

新虫 (小有名气)

水分子数应该不会变,那是一开始你就定好了的~
4楼2010-04-28 07:19:20
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zongyan

铁杆木虫 (正式写手)


gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-28 10:16
只要时间步长与温度合适,用周期性边界条件就不存在这个问题
细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
5楼2010-04-28 08:04:06
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goldenfisher

金虫 (著名写手)


qasd(金币+1):谢谢 2010-04-28 22:31
shengxiang(金币+1): 2010-05-05 06:58:50
要分子数发声变化,除非你用巨正则系综。但是一般都用的是正则系综模拟分子动力学。由于采用了周期边界条件,总的分子数不会变化的。
6楼2010-04-28 16:24:35
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