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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS中动力学之后水分子个数问题
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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】MS中动力学之后水分子个数问题 已有5人参与

我在MS中建立一个盒子，然后加上100个水还有一些其他的分子，那跑完动力学之后水分子个数会发生变化吗？谢谢~~~
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1楼 2010-04-27 08:28:11
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
★
xiaohunhun(金币+1):谢谢 2010-04-27 11:46
我不知道水分子跑到盒子外面 算不算个数发生变化   水分子的总数不会发生变化的呀
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2楼2010-04-27 11:12:56
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-27 20:15
MD应该对原子的位置有约定才对，可以阻止整体的移动，分子的总数应该不发生变化
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2010-04-27 12:48:00
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睡觉的猫

新虫 (小有名气)
水分子数应该不会变，那是一开始你就定好了的~
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4楼2010-04-28 07:19:20
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zongyan

铁杆木虫 (正式写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-04-28 10:16
只要时间步长与温度合适，用周期性边界条件就不存在这个问题
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细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
5楼2010-04-28 08:04:06
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★
qasd(金币+1):谢谢 2010-04-28 22:31
shengxiang(金币+1): 2010-05-05 06:58:50
要分子数发声变化，除非你用巨正则系综。但是一般都用的是正则系综模拟分子动力学。由于采用了周期边界条件，总的分子数不会变化的。
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6楼2010-04-28 16:24:35
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