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yechao258新虫 (初入文坛)
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[求助]
求助:如何NAMD的psf 文件转化成Gromacs的top文件 已有1人参与
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RT 本人今年新研一枚。 老板起先拿了一个体系,让我看懂以后跑namd,但是由于资源有限只能用64个核跑,导致跑一个系统要15天,太慢了。于是老板就让我把namd系统转成gromacs,我对gromacs懂得多一些,对namd就接触了不到一周,不知道从哪里做起。实验室的师兄师姐也没有人做过这样的工作,所以就来小木虫求助了。今天,在网上搜了一天,发现一个Python 里面有一个Pytopol.py ,还有个VMD 里面的topotools可以做,但是网上的解释都不是很清楚。不知道有没有大侠做过这样的工作指点一下。 PS:由于囊肿羞涩,给不起更多的金币了、、 |
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2楼2014-09-04 10:38:28












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