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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Gromacs和NAMD哪个更好
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zongzhiyou

银虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs和NAMD哪个更好

准备要做分子动力学方向的研究，需要大规模技术，据说Gromacs的运算速度比NAMD快，那其他功能对比不知道怎么，请各位大侠能给出一个细致的评论，本人初学得先选择软件，多谢
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来自他乡
1楼 2013-03-14 10:29:40
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zongzhiyou: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-04-01 16:10:42
我先学lammps，后学NAMD ,最后gromacs
现在NAMD 和gromacs都在用

NAMD gromacs都挺好的，学一个，另一个自然就会了，而且这两个软件的教程都做的比较好，小木虫也有很多人写的心得体会，总起来说，好好学，还是比较好上手。顺便需要好好学一下VMD
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2楼2013-03-14 10:53:38
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 榧撳姳浜ゆ�? 2013-03-14 15:36:09
lz可以两个都装一下 先按照教程走一边 然后还可以同时测试一下速度
NAMD一开始就是为大规模设计的 GROMACS原来支持的规模不是很大 不过现在应该有所强化了 因为看到EU给他们投了很多资金做开发 最新的4.6.1
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3楼2013-03-14 15:28:51
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NIFENGGAOHUI

金虫 (初入文坛)
内容已删除
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4楼2014-03-25 07:25:22
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th_ink28

新虫 (初入文坛)
楼主当时选择了什么软件？
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5楼2015-10-23 13:10:01
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