24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2164  |  回复: 38

泡菜肉丝

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 重叠PCR 已有8人参与

做重叠PCR,最后一步怎么也合不到一起,两个片段一个三百多一个四百多。做了各种梯度,touch down等,出来目的条带,但是非常淡,而且靠近一百左右有一条小带。希望有经验的朋友帮忙。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

shyh1983

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-31 20:22:04
建议看一下重叠部分的TM值,overPCR能重叠的关键是重叠部分的退火温度,如果高了,两个片段粘不到一块自然就扩不出来你要的750bp的片段。你可以先重叠部分的TM减去2-5℃,10个循环,在用750bp的上下游引物的TM值-5摄氏度,20个循环试试。
9楼2014-07-31 15:24:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaodahe

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-07-31 14:00:29
应该是做overlap PCR吧?不知道你overlap的序列多长?模板浓度如何?另外,100bp左右的条带如果是一坨,可能是引物。
2楼2014-07-31 09:30:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

泡菜肉丝

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaodahe at 2014-07-31 09:30:06
应该是做overlap PCR吧?不知道你overlap的序列多长?模板浓度如何?另外,100bp左右的条带如果是一坨,可能是引物。

嗯,是的,序列大概在750左右,模板浓度没有测过,但是能清晰的看到,也不低,我觉得也是引物,现在是尝试各种都不行,P出来的条带都很暗
3楼2014-07-31 09:43:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaodahe

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-31 20:21:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by 泡菜肉丝 at 2014-07-31 09:43:34
嗯,是的,序列大概在750左右,模板浓度没有测过,但是能清晰的看到,也不低,我觉得也是引物,现在是尝试各种都不行,P出来的条带都很暗...

如果PCR不好弄,可以增加overlap的长度,直接把两个小片段连到一起;或者以较弱的目的片段(750bp)的基础上再一次尝试扩增,反正750bp不容易产生突变。
4楼2014-07-31 11:32:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ksws0465326

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-07-31 14:00:37
个人认为,首先楼主应确认overlap两个片段,A片段下游与B片段上游部分的序列是否相同,个人觉得应该有20-40bp左右的共同序列才能进行重叠;其次,在设计和成AB两个片段时,pcr产物是否单一,浓度多少,考虑是否要进行胶回收提纯,提纯后两片段浓度是多少;再次,根据DNA聚合酶的不同,所需要加入的两个片段的模板量也会不同,50微升体系中有的酶需要加100ng以上的模板,而有的酶只需要加几ng到20几ng;再有,体系中引物浓度是否适中,根据聚合酶的不同退火,延伸的温度都有不同,如退火50-60,延伸68-72等等,pcr反应循环数30-40或者再多。再者,楼主可以试着做下模板浓度梯度。祝楼主早日成功!
5楼2014-07-31 11:45:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

泡菜肉丝

主管区长

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
5楼: Originally posted by ksws0465326 at 2014-07-31 11:45:47
个人认为,首先楼主应确认overlap两个片段,A片段下游与B片段上游部分的序列是否相同,个人觉得应该有20-40bp左右的共同序列才能进行重叠;其次,在设计和成AB两个片段时,pcr产物是否单一,浓度多少,考虑是否要进 ...

嗯嗯,序列确认过了,没问题的,片段也很纯,只是没测过浓度。很好的意见,值得参考,谢谢。也祝你一切顺利。
6楼2014-07-31 11:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

泡菜肉丝

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhaodahe at 2014-07-31 11:32:21
如果PCR不好弄,可以增加overlap的长度,直接把两个小片段连到一起;或者以较弱的目的片段(750bp)的基础上再一次尝试扩增,反正750bp不容易产生突变。...

嗯,我试过用750的,效果更不好,另外做温度梯度感觉都一样,所以我觉得问题主要在模板浓度和引物浓度不适合,需要调整一下,多谢哈。
7楼2014-07-31 12:02:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaodahe

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
7楼: Originally posted by 泡菜肉丝 at 2014-07-31 12:02:37
嗯,我试过用750的,效果更不好,另外做温度梯度感觉都一样,所以我觉得问题主要在模板浓度和引物浓度不适合,需要调整一下,多谢哈。...

不用谢!
8楼2014-07-31 12:04:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smdsfy

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-31 20:22:12
两个片段要切胶纯化,而且要看得见条带,最好测一下浓度,把握好两个片段的比例,然后再一起P,祝你成功!
10楼2014-07-31 16:19:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 泡菜肉丝 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-04-01 3/150 2026-04-01 07:45 by wxiongid
[考研] 350求调剂 +4 阿佳~ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 07:37 by JourneyLucky
[考研] 环境工程297分求调剂一志愿杭高院 +10 GENJIOW 2026-03-31 10/500 2026-04-01 01:30 by 1018329917
[考研] 材料调剂 +3 一样YWY 2026-03-31 3/150 2026-03-31 23:02 by wxiongid
[考研] 318求调剂 +3 笃行致远. 2026-03-31 3/150 2026-03-31 20:27 by 求调剂zz
[考研] 309求调剂 +17 谁不是少年 2026-03-29 17/850 2026-03-31 19:50 by mg1014
[考研] 生医工0831调剂求推荐 +4 小熊睿睿_s 2026-03-27 6/300 2026-03-31 17:12 by 记事本2026
[考研] 考研调剂求助 +7 13287130938 2026-03-31 7/350 2026-03-31 16:39 by 690616278
[考研] 282求调剂 不挑专业 求收留 +4 Yam. 2026-03-30 5/250 2026-03-31 14:41 by 王亮_大连医科大
[考研] 一志愿大连理工大学,机械工程学硕,341 +3 西瓜田的守望者 2026-03-30 3/150 2026-03-31 11:08 by asdfzly
[考研] 085600,专业课化工原理,320分求调剂 +6 大馋小子 2026-03-29 6/300 2026-03-31 10:03 by 氯化亚硝酰
[考研] 一志愿华中师范化学332分求调剂 +3 Lyy930824@ 2026-03-29 3/150 2026-03-30 20:15 by DHUSHUAI
[考研] 329求调剂 +8 星野? 2026-03-26 8/400 2026-03-30 13:41 by chemdavid
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-29 20:21 by dophin1985
[考研] 299求调剂 +10 15188958825 2026-03-25 10/500 2026-03-29 17:51 by 王亮_大连医科大
[考研] 298求调剂 +3 种圣赐 2026-03-29 3/150 2026-03-29 12:06 by longlotian
[考研] 一志愿吉大071010,316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
信息提示
请填处理意见