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关于本地blast的问题 已有2人参与
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求大神指导！我是用的单机版blast，输出的txt文本只有1KB且没有有用信息。不知道为什么会出现这样的情况。 具体步骤如下： 我下载了blast-2.2.26-ia32-win32，下了nr数据库，并把nr和我要测的序列复制到了bin文件夹中，把我要测序的序列命名为seqin，分别去掉了扩展名。 在cmd中，到了bin，进行fromatdb -i nr -p F，又输入blastall -p blastn -i seqin.txt -d nr -e 0.0000000001 -o seqout.txt，可是最后输出的txt都只有1KB，且没有有用信息。 本人接触blast没几天，上面的步骤都是我根据各种教材拼拼凑凑来的，我还属于一窍不通状态，不知道上面过程哪里出错了，如果整体不对望给出详细过程～～谢谢啦！ [ Last edited by numb123 on 2014-7-18 at 21:17 ] |
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3楼2014-07-20 08:13:11
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 4
- 应助: 599 (博士)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-21 08:25:04
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/ nr你是怎么下载的？有没有用update_blastdb？用了的话，那nr就可以直接用，不用formatdb。 你还是仔细看看文档再说 |
2楼2014-07-20 07:17:16
4楼2014-07-21 06:39:17
