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xueyiran2007铜虫 (小有名气)
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VMD显示Lammps轨迹文件.lammpstrj
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利用VMD显示lammps模拟水溶液的轨迹文件，存在如下问题，请各位大神帮忙： 1. 利用CPK显示，由于周期性边界，有些盒子边界的H-O键，跨过整个盒子，请问如何去除这些键？ 2 水中H-H之间没键，但VMD上H-H之间却显示成键，请问这个如何去除？ 3. H，O原子半径大小显示相同，实际上O的半径要大，如何设定H,O的半径？ 我试图用VMD-graphics-representations-create rep-selected atoms来选择H，O，但选择不上，请问selected atoms选项如何输入才能选择上某个原子？我查看了下手册，没搞明白。 |
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2楼2014-07-15 19:14:57
mileyfan
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