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这样的高斯计算可否?
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小楼丁丁
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这样的高斯计算可否?
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小虫是高斯计算的菜菜鸟,目前碰到一个问题,望各位大神给予解决。问题解决后金币可加。
菜鸟目前想要购买几种化合物。化合物是带有N和COOH的卤代芳香化合物,故在不同pH条件下,分子的带电量不一致。所以我想用高斯计算分别计算电量为,0,-1,+1条件下不同位置上C-X键的键能。然后用此指导购买化合物,不知可不可行?高斯计算所用的方法和基组参照文献。分别进行opt+Freq的计算。
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1楼
2014-07-09 14:09:17
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2楼
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Originally posted by
oinkmasta
at 2014-07-09 23:25:42
看起来不是很好操作,因为gaussian其实没有键的概念。所以键能怎么算啊,先算整个分子再把C-X键和它们的距离都拆开吗?那样需要冻结拆开以后的C-X的距离,否则优化又会把这个键连回去的。其次,Gaussian里的电荷只能 ...
用不同位置上C-X键的键能理论上指导脱X的顺序。比如一个3,6-二氯苯甲酸,通过计算3,6-二氯苯甲酸的热力学常数,和3-氯苯甲酸,5-氯苯甲酸的热力学常数。相减得到不同位置上C-X键的键能。
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3楼
2014-07-10 12:12:22
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看起来不是很好操作,因为gaussian其实没有键的概念。所以键能怎么算啊,先算整个分子再把C-X键和它们的距离都拆开吗?那样需要冻结拆开以后的C-X的距离,否则优化又会把这个键连回去的。其次,Gaussian里的电荷只能分布在整个体系当中(而不能指定多少电荷在哪个fragment上),所以拆开键后放在同一个输入文件里的计算应当是不精确的。
可以试试看先算整个分子,然后断键之后拆成两个fragment分别计算,注意电荷守恒。
此外我不懂带电量和键能如何指导购买这些化合物,用键能推断稳定性?
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16届本科在北美
2楼
2014-07-09 23:25:42
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3楼
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小楼丁丁
at 2014-07-09 16:12:22
用不同位置上C-X键的键能理论上指导脱X的顺序。比如一个3,6-二氯苯甲酸,通过计算3,6-二氯苯甲酸的热力学常数,和3-氯苯甲酸,5-氯苯甲酸的热力学常数。相减得到不同位置上C-X键的键能。...
懂了,谢谢说明!
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4楼
2014-07-10 12:19:41
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at 2014-07-10 12:19:41
懂了,谢谢说明!...
我想问的是这样子可行吗?
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5楼
2014-07-10 13:58:46
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