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dlstella

银虫 (小有名气)

[求助] 求问:用高斯怎么算electron density

求问:用高斯怎么算electron density,就是那种分子上可以显示不同颜色表示的那种。
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zhou2009

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-07-11 10:11:15
dlstella(金币+10): 2011-07-11 16:46:58
用高斯算electron density,可以有多种途径:

用cubegen命令,或者cube关键词,指定求density,得到electron density的cube文件,然后显示其图形来。详见本论坛帖子或操作手册。

此外,也可以将计算得到的chk文件改写成fch文件,将文件读入multiwfn程序中,指定求density,得到electron density的cube文件。

你说“就是那种分子上可以显示不同颜色表示的那种”,如果只是electron density的等值面图,因只有正值只有单一的颜色。如果是截面的等值线图可以用不同颜色表示。

电子密度差可以用两种颜色表示。

你不会是指静电势吧?它也是“那种分子上可以显示不同颜色表示的”。
2楼2011-07-11 09:43:33
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dlstella

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-07-11 09:43:33:
用高斯算electron density,可以有多种途径:

用cubegen命令,或者cube关键词,指定求density,得到electron density的cube文件,然后显示其图形来。详见本论坛帖子或操作手册。

此外,也可以将计算得到的c ...

我想要的应该就是你说的那种“截面的等值线图”。你说的用cubegen求得的electron density的cube文件 最后也是用GV打开看吗?我把chk文件打开用里面的cube算了 ,出来的就是一大坨一种颜色的,我就是想要那种两种颜色表示的,能不能请你详细的再讲一下,或者给个输入文件的范本,好吗?谢谢了!最后的文件打开也是用GaussView吗?
3楼2011-07-11 16:46:18
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zhou2009

版主 (著名写手)

你说“一大坨一种颜色”的,如果你所求无误,这就是你要的electron density的等值面图,它只有正值,固只有一种颜色。可以通过等值面值的大小,改变此图的可视性。

“截面的等值线图”,也是一种颜色的。也是在GaussView 5中显示的。

“想要那种两种颜色表示的”,那就是电子密度差:electron density difference。是吗?
4楼2011-07-11 19:15:38
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dlstella

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-07-11 19:15:38:
你说“一大坨一种颜色”的,如果你所求无误,这就是你要的electron density的等值面图,它只有正值,固只有一种颜色。可以通过等值面值的大小,改变此图的可视性。

“截面的等值线图”,也是一种颜色的。也是在 ...

对对对,就是electron density difference ,这个怎么算啊?
5楼2011-07-11 19:28:48
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zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★
小红豆(金币+3): 感谢分享 2011-07-12 08:48:01
详见我编写的《量子化学图形显示手册》:

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1616092
6楼2011-07-11 19:43:54
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dlstella

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-07-11 19:43:54:
详见我编写的《量子化学图形显示手册》:

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1616092

谢谢哈!!!
7楼2011-07-11 21:27:25
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