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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯09 BOMD 计算能量守恒差怎么能办？
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luosizuo

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1楼 2012-12-16 10:41:59
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yflchx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-12-16 14:43:42
luosizuo: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-16 18:33:08
luosizuo: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-17 09:11:19
luosizuo: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-12-17 13:49:32
如果采用预测校正的积分方法，减小update数值，或者减小积分步长试试。
采用这种方法，积分时间比较长的话，能量守恒会变差。


也可以试着换成velocity verlet方法积分trajectory。
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2楼2012-12-16 11:41:40
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luosizuo

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3楼2012-12-16 18:36:29
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yflchx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-16 18:36:29
你好，我采用的的却是预测校正 Bulirsch - Stoer algorithm这种积分方法，我也看到了诱人用velocity verlet方法积分。这两种方法有何差异吗？哪种计算量大？
还有我们看到BOMD的关键字里可以切换这两种积分方法的 ...

计算量的话，我没比较过。你可以尝试比较一下。

预测校正方法长时间积分能量漂移大。

我想用velocity verlet会好不少。
我记得在GAUSSIAN03中用IOP(1/71=-1)，你查查IOP手册，我很久没用过GAUSSIAN了。

至于在GAUSSIAN09中用哪个IOP，我就不清楚了，你自己查查吧。
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luosizuo luosizuo luosizuo
4楼2012-12-16 20:48:16
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luosizuo

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5楼2012-12-17 09:13:31
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7楼2012-12-17 15:50:37
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金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-17 15:50:37
测试了一下，velocity verlet积分不如预测校正方法，有时候能量漂移快到0.001a.u.而相同初始条件下预测校正方法能量漂移都小于0.0001，大部分时间在0.00001.能有什么办法让velocity verlet积分漂移小一点吗？...

你用的步长是多少fs？

看来只能减小步长，我想可能是默认的步长太大。

我最近一直在用GAMESS里面的DRC做trajectory（velocity verlet），步长一般设为0.1 fs或者更小。
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8楼2012-12-17 16:31:22
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luosizuo

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9楼2012-12-17 17:35:35
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yflchx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-17 17:35:35
步长是0.25fs，在把不长减小计算量会增加不少。而且奇怪的是，相同条件计算，有时候出现能量漂移大的地方好像也不一样。相同轨迹模拟GAMESS计算量会比gaussian大吗？...

我没比较过，现在也没有GAUSSIAN程序。

步长改成0.05fs看看还有明显的能量漂移吗？这样计算量会很大。

一般来说，能量守恒在0.1kal/mol以内就算可以了吧。
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10楼2012-12-17 18:30:01
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