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luosizuo

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yflchx

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-12-16 14:43:42
luosizuo: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-16 18:33:08
luosizuo: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-17 09:11:19
luosizuo: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-12-17 13:49:32
如果采用预测校正的积分方法,减小update数值,或者减小积分步长试试。
采用这种方法,积分时间比较长的话,能量守恒会变差。


也可以试着换成velocity verlet方法积分trajectory。
2楼2012-12-16 11:41:40
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luosizuo

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3楼2012-12-16 18:36:29
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yflchx

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引用回帖:
3楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-16 18:36:29
你好,我采用的的却是预测校正 Bulirsch - Stoer algorithm这种积分方法,我也看到了诱人用velocity verlet方法积分。这两种方法有何差异吗?哪种计算量大?
还有我们看到BOMD的关键字里可以切换这两种积分方法的 ...

计算量的话,我没比较过。你可以尝试比较一下。

预测校正方法长时间积分能量漂移大。

我想用velocity verlet会好不少。
我记得在GAUSSIAN03中用IOP(1/71=-1),你查查IOP手册,我很久没用过GAUSSIAN了。

至于在GAUSSIAN09中用哪个IOP,我就不清楚了,你自己查查吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-12-16 20:48:16
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luosizuo

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5楼2012-12-17 09:13:31
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6楼2012-12-17 13:50:51
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7楼2012-12-17 15:50:37
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【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-17 15:50:37
测试了一下,velocity verlet积分不如预测校正方法,有时候能量漂移快到0.001a.u.而相同初始条件下预测校正方法能量漂移都小于0.0001,大部分时间在0.00001.能有什么办法让velocity verlet积分漂移小一点吗?...

你用的步长是多少fs?

看来只能减小步长,我想可能是默认的步长太大。

我最近一直在用GAMESS里面的DRC做trajectory(velocity verlet),步长一般设为0.1 fs或者更小。
8楼2012-12-17 16:31:22
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9楼2012-12-17 17:35:35
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【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-17 17:35:35
步长是0.25fs,在把不长减小计算量会增加不少。而且奇怪的是,相同条件计算,有时候出现能量漂移大的地方好像也不一样。相同轨迹模拟GAMESS计算量会比gaussian大吗?...

我没比较过,现在也没有GAUSSIAN程序。

步长改成0.05fs看看还有明显的能量漂移吗?这样计算量会很大。

一般来说,能量守恒在0.1kal/mol以内就算可以了吧。
10楼2012-12-17 18:30:01
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