24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2527  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

魔术师杨

银虫 (小有名气)

[求助] 转录因子结合位点 已有2人参与

谁有免费预测转录因子结合位点的软件呀?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jocking2000

铁虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-09 16:06:47
软件统一楼上的,转录因子的预测,还是老牌的那么几个,就是数据库基本停止更新。
这两个比较用的多。
TFSEACH
还有就是收费的。
4楼2014-07-09 11:37:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-03 12:03:00
据说JASPAR可以,http://jaspar.genereg.net/,自己还没有研究。
2楼2014-07-02 23:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-07-03 12:03:10
转录因子数据库与转录因子预测软件

转录因子数据库:
TRANSFAC:
http://www.gene-regulation.com/pub/databses.html
TRRD:
http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/trrd/
TFD:
http://www.ifti.org/
JASPAP :
http://jaspar.cgb.ki.se/
DBTSS:
http://dbtess.hgc.jp/

转录因子预测软件:
March 1.0
http://compel.binet.nsc,ru/March/March.html
TFSEACH
http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEACH.html
MAPPER
http://mapper.chip.org
P-March:
http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html
TESS
http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
PatSearch
http://www.ba.itb.cnr.it/BIG/PatSearch
m2transfac
http://explain.biobase.de/cgi-bin/m2transfac/bin/start.cgi
Signal Scan
http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/signal/

有关软件的使用方法在MMB 系列里有transcriptional factor一卷,我忘了具体是哪卷了,抱歉!下午要去开会,改日传上来。
3楼2014-07-03 11:33:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 专硕0854初试考材科基,求调剂 +7 3220548044 2026-04-06 10/500 2026-04-08 21:59 by hypershenger
[考研] 277求调剂 +16 倪建设 2026-04-06 16/800 2026-04-08 21:28 by zhouxiaoyu
[考研] 325分化学调剂 +9 15771691647 2026-04-02 9/450 2026-04-08 19:21 by ruoyu867
[考研] 266求调剂 +18 阳阳哇塞 2026-04-07 18/900 2026-04-08 12:59 by grayjzr
[考研] 297求调剂 +16 GENJIOW 2026-04-07 17/850 2026-04-08 11:05 by 逆水乘风
[考研] 285求调剂 +18 AZMK 2026-04-02 19/950 2026-04-08 10:33 by xingguangj
[考研] 电子信息270求调剂 +7 terminal469 2026-04-07 7/350 2026-04-08 08:48 by tt19890111
[考研] 331求调剂 +5 张元一 2026-04-07 6/300 2026-04-07 22:13 by hemengdong
[考研] 作栽330调剂 +3 我要上好学 2026-04-02 4/200 2026-04-07 19:54 by biomichael
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +16 熊二想上岸 2026-04-04 17/850 2026-04-07 14:58 by BruceLiu320
[考研] 372分材料与化工(085600)英二数二求调剂 +4 蓝笺片 2026-04-06 4/200 2026-04-07 12:30 by dongzh2009
[论文投稿] Decision: Revise for Editor还会送审吗 100+3 CccccccccFD 2026-04-04 5/250 2026-04-07 10:58 by 北京莱茵润色
[考研] 319分085702安全工程求调剂 +6 rious 2026-04-05 6/300 2026-04-07 09:42 by jp9609
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:13 by 啵啵啵0119
[考研] 环境285分,过六级,求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 考研调剂 +5 小sun要好运 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:43 by 啵啵啵0119
[考研] 295求调剂 +7 愿旅途永远坦然 2026-04-02 7/350 2026-04-03 08:22 by fangshan711
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
信息提示
请填处理意见