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秋隐vs蚯蚓

铜虫 (初入文坛)

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专业: 微生物遗传育种学

[求助] 怎么来界定一个新基因已有2人参与

我从我的菌株的基因组上扩增出一个基因，NCBI blast比对与某种菌株的碱基及氨基酸同源性均达70多，我的菌中还没有该基因的研究，我能否认为我扩增出来的基因就是NCBI上比对出那个基因呢？

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1楼 2014-06-29 09:53:01

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

70%相似的话，都可以用来预测蛋白结构了，因为他们太相似了

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3楼2014-06-30 06:33:38

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toddy99

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-06-29 15:11:35
秋隐vs蚯蚓: 金币+2, ★有帮助 2014-06-29 15:37:17

碱基同源性都达到70%！几乎可以肯定是homologue，
至于是orthologue 还是 paralogue 可以在自己和参考genome里面blast一下。
有些homology只有30%的蛋白都是homologue--前提是不是仅仅一个domain相似，而是“整体相似”。

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2楼2014-06-29 10:59:28

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[求助] 怎么来界定一个新基因 已有2人参与

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toddy99

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