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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 怎么来界定一个新基因
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秋隐vs蚯蚓

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎么来界定一个新基因 已有2人参与

我从我的菌株的基因组上扩增出一个基因，NCBI blast比对与某种菌株的碱基及氨基酸同源性均达70多，我的菌中还没有该基因的研究，我能否认为我扩增出来的基因就是NCBI上比对出那个基因呢？
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1楼 2014-06-29 09:53:01
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toddy99

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-06-29 15:11:35
秋隐vs蚯蚓: 金币+2, ★有帮助 2014-06-29 15:37:17
碱基同源性都达到70%！ 几乎可以肯定是homologue，
至于是orthologue 还是 paralogue 可以在自己和参考genome里面blast一下。
有些homology只有30%的蛋白都是homologue--前提是不是仅仅一个domain相似，而是“整体相似”。
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2楼2014-06-29 10:59:28
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
70%相似的话，都可以用来预测蛋白结构了，因为他们太相似了
赞一下 回复此楼
3楼2014-06-30 06:33:38
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