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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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秋隐vs蚯蚓

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎么来界定一个新基因 已有2人参与

我从我的菌株的基因组上扩增出一个基因,NCBI blast比对与某种菌株的碱基及氨基酸同源性均达70多,我的菌中还没有该基因的研究,我能否认为我扩增出来的基因就是NCBI上比对出那个基因呢?
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toddy99

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-06-29 15:11:35
秋隐vs蚯蚓: 金币+2, 有帮助 2014-06-29 15:37:17
碱基同源性都达到70%! 几乎可以肯定是homologue,
至于是orthologue 还是 paralogue 可以在自己和参考genome里面blast一下。
有些homology只有30%的蛋白都是homologue--前提是不是仅仅一个domain相似,而是“整体相似”。
2楼2014-06-29 10:59:28
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
70%相似的话,都可以用来预测蛋白结构了,因为他们太相似了
3楼2014-06-30 06:33:38
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