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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 请问测序完成后怎么建立菌种系统发育树？
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伊天_1990

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请问测序完成后怎么建立菌种系统发育树？ 已有1人参与

我是做的菌种的分离鉴定，已经送去公司测序，我想知道测序结果出来后建立系统发育树的详细步骤？因为一点都不知道。
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啦啦啦
1楼 2014-05-21 22:20:20
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辛格王朝

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
伊天_1990: 金币+2, ★★★很有帮助, 我看看，已经blast了。 2014-05-23 09:02:16
参照MEGA5手册~之前要用NCBI BLAST
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做不好实验的苦逼
4楼2014-05-22 13:56:22
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神
参考你帖子下面的推荐，里面太多了
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2楼2014-05-21 22:47:33
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ASHzoulan

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2014-05-22 10:01:21
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半夏小妖啊

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ASHzoulan at 2014-05-22 10:01:21
将测得序列在NCBI中进行比对，根据比对结果选取标准菌株，并从NCBI中获得标准菌株序列。将你的菌株和标准菌株序列在Mega中进行建树。

请问blast出来的100条菌株序列中，如何挑选合适的可建树的标准菌株序列呢？
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5楼2021-03-08 17:21:38
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