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请问测序完成后怎么建立菌种系统发育树?
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伊天_1990
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请问测序完成后怎么建立菌种系统发育树?
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我是做的菌种的分离鉴定,已经送去公司测序,我想知道测序结果出来后建立系统发育树的详细步骤?因为一点都不知道。
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请教:系统发育树怎么做?
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啦啦啦
1楼
2014-05-21 22:20:20
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dllchina
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2014-05-21 22:47:33
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3楼
2014-05-22 10:01:21
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专业: 微生物资源与分类学
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伊天_1990: 金币+2,
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很有帮助, 我看看,已经blast了。
2014-05-23 09:02:16
参照MEGA5手册~之前要用NCBI BLAST
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做不好实验的苦逼
4楼
2014-05-22 13:56:22
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半夏小妖啊
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专业: 食品科学基础
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
ASHzoulan
at 2014-05-22 10:01:21
将测得序列在NCBI中进行比对,根据比对结果选取标准菌株,并从NCBI中获得标准菌株序列。将你的菌株和标准菌株序列在Mega中进行建树。
请问blast出来的100条菌株序列中,如何挑选合适的可建树的标准菌株序列呢?
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5楼
2021-03-08 17:21:38
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