24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2997  |  回复: 4

chenjingzhi

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学模拟计算自由能都有哪些方法? 已有2人参与

看Frenkel的书上有提到热力学积分法、Widom粒子插入法以及伞形抽样法,但是作者没有提及这些方法哪些使用于MC,而哪些使用于MD,我做的是MD模拟,请问用MD来计算化学势都有哪些方法,它们是如何操作的?
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chenjingzhi: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-05-20 17:57:44
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 19:12:49
这些方法MD和MC都适用,一般都是读取轨迹文件然后进行计算。

Widom Insertion是计算化学势比较经典的方法,Frenkel的书上有伪代码。
2楼2014-05-20 11:53:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chenjingzhi: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-05-20 17:57:54
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 19:12:54
只计算自由能差的话有FEP和TI方法

计算PMF的话可以有umbrella sampling,ABF,metadynamics,SMD等等。。
3楼2014-05-20 13:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenjingzhi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-05-20 11:53:03
这些方法MD和MC都适用,一般都是读取轨迹文件然后进行计算。

Widom Insertion是计算化学势比较经典的方法,Frenkel的书上有伪代码。

谢谢,我再仔细看看
4楼2014-05-20 17:57:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

送红花一朵
楼主,您自由能算的怎么样,求指点下啊,我Q57436912,或者您给我留个Q
5楼2019-03-13 18:44:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenjingzhi 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 301求调剂 +12 A_JiXing 2026-04-01 12/600 2026-04-01 22:47 by peike
[考研] 319求调剂 +9 太容易1018 2026-04-01 9/450 2026-04-01 21:58 by 我的船我的海
[考研] 270求调剂 +7 小杰pp 2026-03-31 8/400 2026-04-01 21:36 by 七度不信任
[考研] 286求调剂 +16 PolarBear11 2026-03-26 16/800 2026-04-01 21:31 by 七度不信任
[考研] 303分 0807学硕求调剂 +3 TYC3632 2026-04-01 3/150 2026-04-01 19:24 by lwk2004
[考研] 求生物学调剂 +7 15172915737 2026-04-01 7/350 2026-04-01 15:27 by 闲人终南山
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +5 小叮当来了 2026-03-30 6/300 2026-04-01 14:25 by mxj1203
[考研] 358求调剂 +3 王向阳花 2026-03-31 3/150 2026-04-01 09:56 by zzchen2000
[考研] 0710生物学求调剂! +6 叙述文 2026-03-31 6/300 2026-04-01 09:39 by JourneyLucky
[教师之家] 张雪峰戛然而止的飞驰人生 +3 yexuqing 2026-03-26 4/200 2026-04-01 08:20 by 湖心亭看雪
[考研] 求调剂:一志愿:南京大学 专业:0705 总分320 ,本科985,四六级已过 +3 lfy760306 2026-03-31 3/150 2026-04-01 01:57 by Creta
[考研] 材料与化工272求调剂 +25 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 25/1250 2026-03-31 16:27 by hypershenger
[考研] 085601 329分调剂 +6 yzsa12 2026-03-31 6/300 2026-03-31 15:23 by yanflower7133
[考研] 一志愿食品科学与工程083200求调剂 +4 XQTJZ 2026-03-30 4/200 2026-03-31 04:10 by fmesaito
[考研] 福建理工大学材料学院先进合金团队招收考研调剂学生 +3 大华金商都 2026-03-30 4/200 2026-03-31 01:04 by 方英俊602
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
[考研] 283求调剂(080500) +14 A child 2026-03-27 14/700 2026-03-30 12:06 by 探123
[考研] 环境科学与工程334分求调剂 +6 王一一依依 2026-03-30 8/400 2026-03-30 11:52 by yjolah
[考研] 070305高分子化学与物理 304分求调剂 +12 c297914 2026-03-28 12/600 2026-03-29 16:21 by Serene1974
[考研] 调剂 +4 柚柚yoyo 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:43 by fmesaito
信息提示
请填处理意见