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【求助】吉布斯自由能的计算 Ｇ 已有4人参与
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| 不知道那个分子动力学模块可以计算体系的吉布斯自由能，因为要计算的体系比较大，所以想知道Discover能不能计算，或则那个模块可以计算。 |
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2楼2010-06-18 15:30:16
sikasun
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MD不能直接计算自由能的，因为熵不是体系的微观性质的平均量。所以只能通过间接方法计算，例如计算沿某个反应坐标的相对自由能，可以把自由能转化为反应坐标上的不同点的概率，再通过概率比转化为自由能差。 量子化学计算某个分子的自由能(比如DMOL3)基本都是理想气体近似方法，因为理想气体假定分子间没有相互作用，因此单个分子就能模拟气体体系的性质。怎么算呢？势能量当作焓H, 动能按RT，熵呢，通过计算简谐振动近似下的频率计算振动熵贡献，刚性转子近似计算转动熵，以及平动熵得到自由能。但这种计算不适合于计算凝聚态体系，即液相或固体。凝聚态只能通过MD方法得到。 参考：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3672663&page=1 |
6楼2012-03-18 19:27:18
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