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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】吉布斯自由能的计算 Ｇ
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wthpl

[交流] 【求助】吉布斯自由能的计算 Ｇ已有4人参与

不知道那个分子动力学模块可以计算体系的吉布斯自由能，因为要计算的体系比较大，所以想知道Discover能不能计算，或则那个模块可以计算。
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1楼2010-06-18 15:22:50
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163.com

金虫 (著名写手)

实习版主
wthpl(金币+1): 2010-06-19 14:05:48
能求，现在不记得具体怎么操作了

抢个沙发……
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阿什顿联
2楼2010-06-18 15:30:16
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sikasun

木虫 (正式写手)
wthpl(金币+1): 2010-06-19 14:05:53
Dmol能算
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3楼2010-06-18 15:44:41
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wthpl

引用回帖:
Originally posted by 163.com at 2010-06-18 15:30:16:
能求，现在不记得具体怎么操作了

抢个沙发……

大哥 or 大姐，帮忙想想吧，对你来说可能不算什么，可是对我很重要
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4楼2010-06-18 15:52:31
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lz830617

铁杆木虫 (正式写手)
wthpl(金币+2): 2010-06-19 14:06:00
GULP可以，势函数比较多。
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5楼2010-06-18 19:57:03
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
MD不能直接计算自由能的，因为熵不是体系的微观性质的平均量。所以只能通过间接方法计算，例如计算沿某个反应坐标的相对自由能，可以把自由能转化为反应坐标上的不同点的概率，再通过概率比转化为自由能差。

量子化学计算某个分子的自由能(比如DMOL3)基本都是理想气体近似方法，因为理想气体假定分子间没有相互作用，因此单个分子就能模拟气体体系的性质。怎么算呢？势能量当作焓H, 动能按RT，熵呢，通过计算简谐振动近似下的频率计算振动熵贡献，刚性转子近似计算转动熵，以及平动熵得到自由能。但这种计算不适合于计算凝聚态体系，即液相或固体。凝聚态只能通过MD方法得到。

参考：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3672663&page=1
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6楼2012-03-18 19:27:18
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
恩，上面我贴有错，Dmol3可以计算理想晶体的自由能。方法跟理想气体差不多。
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7楼2012-03-18 19:29:19
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