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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » graphene的分子动力学计算
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小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] graphene的分子动力学计算 已有1人参与

看很多文章用md去检查确定温度下结构稳定性。我想学习一下，就做了石墨烯的分子动力学模拟。我采用的是nvt系综（smass=3 应该就是nvt系综吧？），在300K的Nose-Hoover 调温器（是不是就是所谓的热浴的啊？），石墨烯2x2的超包，得到了温度和总能随时间变化曲线：如下图。
图中温度感觉还可以是在300k处震荡，但是总能为什么是一直减小的呢？这代表这什么。望指教。
我的INCAR：
ISTART = 0
ICHARG = 2
PREC = Normal
ENCUT = 400
ISMEAR = 0
SIGMA=0.1
EDIFF=1E-5
IBRION=0
NSW=30000
TEBEG=300
TEEND=300
SMASS=0
NBLOCK=1
MDALGO=2
机构是这样的：
POSCAR：
POTIM=1POSCAR-1x1
1.0
        4.9355001450         0.0000000000         0.0000000000
        2.4677873519         4.2742469824         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        10.0000000000
    C
    8
Direct
     0.166700006         0.166600004         0.500000000
     0.166700006         0.666599989         0.500000000
     0.666700006         0.166600004         0.500000000
     0.666700006         0.666599989         0.500000000
     0.333299994         0.333299994         0.500000000
     0.333299994         0.833299994         0.500000000
     0.833299994         0.333299994         0.500000000
     0.833299994         0.833299994         0.500000000

graphene的分子动力学计算
temp-time.png


graphene的分子动力学计算-1
energy-time.png


graphene的分子动力学计算-2
石墨烯 2x2 超包.png
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1楼 2014-03-25 14:46:46
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stractor

金虫 (著名写手)
你的温度波动幅度也很大哦。估计是SMASS的影响
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2楼2014-03-26 11:38:24
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stractor

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小木虫于: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2014-03-27 16:05:41
看能量，是看总自由能，是OSZICAR中的 F 后面的值。不能看总能，总能包含了动能和那个热浴的能量。
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3楼2014-03-26 12:00:09
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stractor at 2014-03-26 11:38:24
你的温度波动幅度也很大哦。估计是SMASS的影响

这个smass该怎么调节呢，vasp说明书上说的没看明白。我这里取得是0，如果取成3会好么，我看vasp说明书上用的3.
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4楼2014-03-26 14:00:37
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stractor at 2014-03-26 12:00:09
看能量，是看总自由能，是OSZICAR中的 F 后面的值。不能看总能，总能包含了动能和那个热浴的能量。

多谢，我用F做了图，不像总能那样减小了，是围绕这一个值震动的了。但是也像温度那样，震动的幅度比较剧烈。
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5楼2014-03-26 14:01:56
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