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dongyanbest

新虫 (初入文坛)

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[求助] 为什么细菌基因组提取出来总是23K？已有4人参与

RT，提取到的细菌基因组进行琼脂糖电泳后，条带总在23K附近？请专业人士回复，最好能注明出处，写论文用，谢谢~

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1楼 2014-05-12 22:38:16

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luwei13566

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引用回帖:

6楼: Originally posted by dongyanbest at 2014-05-15 19:47:21
谢谢回复~这个大小确实是正常的，后续实验也挺顺利你的~我只是在想，是什么原来原因让它恰好是是23K这个大小呢？怎么解释呢？...

首先你怎么这么确定你的基因组大小就是23K呢，HandIII最下面两条带差400bp，然后依次向上，最上面的两条带之间都能差13K，量程差异已经很大了，你提的基因组在23K那条marker的上面吧，别看高那么一点，说不定就能再大30K呢？你的DNA既然已经超过量程就没法说出大小了，只能说大于23K。
其次，用Marker判断DNA大小仅限于简单线性的DNA，LZ你说说为啥质粒跑出来的电泳会比实际的低？3M的基因组如果没有大量的盘旋折叠细胞根本就装不下，折叠的形状就像一根长线你把它乱扯成的一坨的形状类似，这种形状不能用Marker来判断大小。而且你提的基因组肯定不是一条细带吧，而是一个范围内的拖带，这就是大量折叠的DNA的形式。
这里根本不用引用啥，提的基因组图片直接放上去，没人会在这里提问。