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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 为什么细菌基因组提取出来总是23K？
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dongyanbest

新虫 (初入文坛)

[求助] 为什么细菌基因组提取出来总是23K？ 已有4人参与

RT，提取到的细菌基因组进行琼脂糖电泳后，条带总在23K附近？请专业人士回复，最好能注明出处，写论文用，谢谢~
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1楼 2014-05-12 22:38:16
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
dongyanbest(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-05-13 17:57:47
Marker越靠上量程越大，一般基因组大小在marker最上面即可，而且基因组各种超螺旋缠绕都可能，大小在23K处很正常
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大家相互帮助哈
3楼2014-05-13 16:14:19
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yonglu

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dongyanbest(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-05-13 17:57:40
首先有以下疑问：
1、最好附上电泳图：Marker用的是哪个？λ/HindIII DNA Marker？凝胶浓度及电泳条件？
2、gDNA上样量多少？
3、也许你所提取的细菌基因组大小就在23kb左右呢。
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www.southgene.com
2楼2014-05-13 14:26:11
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你纠结在这个不是问题的问题，不应该啦，在琼脂糖胶上比较23k和24k的差别，貌似没有太多意义。

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2014-05-13 17:34:48
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dongyanbest

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yonglu at 2014-05-13 14:26:11
首先有以下疑问：
1、最好附上电泳图：Marker用的是哪个？λ/HindIII DNA Marker？凝胶浓度及电泳条件？
2、gDNA上样量多少？
3、也许你所提取的细菌基因组大小就在23kb左右呢。

我用的λ/HindIII DNA Marker，0.8%电泳，我的基因组是3.5M，已经测序完成了~只是现在在想为什么提取的基因组总是23K呢？求指点，谢谢~！
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5楼2014-05-15 19:43:55
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