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yichen0405

铜虫 (小有名气)

[求助] 怎么计算含有特定碱基序列的基因的含量 已有1人参与

碱基序列很短，到底怎么做呢？求助大神啊
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加油
1楼 2014-04-14 10:19:35
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yichen0405

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-04-14 18:06:59
以前老师叫我找过一些这样的基因。她先把拟南芥所有的基因给我，然后再给出一段序列，要求从拟南芥基因中找出所有含有那段制定序列的基因。不知道你要找的是不是这样，要是类似我可以帮你找找。...

那你是怎么做的啊?我现在只知道在NCBI上查，而且还不怎么会用。老师让我在人类基因组里找到含有特定序列的基因，还要知道含量，好难啊
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加油
5楼2014-04-16 10:43:04
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你说的“含量”应该是一个比例吧，要算这个比例就先把所有的目标基因都下载好，然后用你的碱基序列去匹配。要写一个计算机代码才能完成所有匹配。
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2楼2014-04-14 12:59:19
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yichen0405

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-04-14 12:59:19
你说的“含量”应该是一个比例吧，要算这个比例就先把所有的目标基因都下载好，然后用你的碱基序列去匹配。要写一个计算机代码才能完成所有匹配。

目标基因是含有我的特定碱基序列的基因吗？你说的计算机代码完成匹配，我确实不会啊。不知道你那有没有相关的文献，告诉我啊
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加油
3楼2014-04-14 17:22:18
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by yichen0405 at 2014-04-14 17:22:18
目标基因是含有我的特定碱基序列的基因吗？你说的计算机代码完成匹配，我确实不会啊。不知道你那有没有相关的文献，告诉我啊...

以前老师叫我找过一些这样的基因。她先把拟南芥所有的基因给我，然后再给出一段序列，要求从拟南芥基因中找出所有含有那段制定序列的基因。不知道你要找的是不是这样，要是类似我可以帮你找找。
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4楼2014-04-14 18:06:59
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