24小时热门版块排行榜

返回列表

kindbigbear0

木虫 (正式写手)

应助: 34 (小学生)
金币: 1550.5
散金: 100
红花: 9
帖子: 348
在线: 88.2小时
虫号: 344683
注册: 2007-04-14
性别: GG
专业: 组织工程学

[求助] gene库里面没有包含的种属---如何设计引物已有1人参与

因为需要做兔的cd90检测，但是genebank查到的只有人、猪、鼠、蛙类，没有兔
该如何选择基因序列，然后设计引物呢？
请教这种情况各位是如何处理的呢？
每种都尝试一下？太耗时间了吧
有其它解决办法么？

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

SOS，求助，NCBI上引物比对问题已经有6人回复
新人做qRT-PCR 引物怎么设计？已经有5人回复
使用多对引物进行实时定量PCR后未得到实验结果，是否能说明目的基因不表达？已经有10人回复
特异性Promoter引物该怎么设计啊已经有6人回复
引物设计好了怎么检测它的特异性已经有8人回复
有没有人用过genetool 设计引物呢？已经有1人回复
求高手指点：RT-PCR的引物设计已经有18人回复
向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎已经有19人回复
求助设计好的引物怎样通过blast比对来确定引物的正确性已经有4人回复
已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列，如何设计PVR的上下游引物呢？已经有7人回复
敢问众位大侠每个生物的GAPDH序列都是一样的吗？已经有8人回复
【求助/交流】两条序列只有1-2个变异位点，能设计特异引物区别出来吗？已经有23人回复
【求助/交流】紧急求助~~ 关于简并引物设计 codehop 和genefisher 在线已经有12人回复
【求助/交流】设计的引物在NCBI blast中比对居然没有我的目的片段已经有5人回复
【求助/交流】多重PCR引物设计已经有14人回复

1楼 2014-04-01 10:17:03

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

专家经验: +220
MolEPI: 20
应助: 231 (大学生)
金币: 10387.9
散金: 387
红花: 63
帖子: 540
在线: 151.9小时
虫号: 2811882
注册: 2013-11-19
专业: 生物化学
管辖: 分子生物

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kindbigbear0(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-04-01 13:19:57
kindbigbear0: 金币+1, ★★★★★最佳答案, 高手，可否给出更为详细的操作步骤？你给的链接点开提示错误。感谢！ 2014-05-05 13:17:32

找EST去嘛
人跟兔还是很近的
直接拿人的mRNA序列去兔的基因组里面做blat
然后选择匹配最高的
结果万能的UCSC已经显示这段就是人的THY1了
下面很配合的也有好几条兔的EST
选那个最长的
应该差不多了，就这么点，够你设计引物的了

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucest/EB373833
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/h ... amp;table=intronEst