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高斯溶剂化能求助 已有1人参与
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本人新手，因为化合物C12H12N2O3，有顺反异构，导师突然要求用高斯计算，但是关于量子化学的知识一点儿也没有，最近发文在即，比较急切。 先简单说一下我现在用的方法 我用的是gaussain03W的软件，之前用的是结构优化，分两步，第一步是hf/3-21g opt，然后第二步是# B3LYP/6-31G* opt geom=checkpoint guess=checkpoint freq pop=(reg ,nbo)，这是早前毕业的师兄摸索的。 由于做了单晶，发现反式为主，所以理应是反式稳定，结果计算结果都是顺式稳定，所以我猜想可能是因为没有考虑溶剂的原因。 问题如下： 1、我应该用什么命令语句，且这个命令在第几步的使用。(希望能全部写给我，我真是一点儿不会，尝试了几个，结果运行之后秒停，崩溃了) 2、计算溶剂能的时候，选用哪个溶剂？我这个化合物正好有个单晶，是在丙酮和石油醚的情况下培养得到的，单晶显示有异构体，反式为主。同时核磁是氢谱用氯仿打的，核磁碳谱是DMSO打的，那我在选择溶剂的时候，solvent=? 3、如果最后计算完毕，我应该看哪个数值来判断哪个异构体更稳定呢？ 求各位帮帮忙，如果需要附我的相关结果，我可以附上。下面先贴两个哈。 5-h-a是反式，5-h-c是顺式，-1是第一次输出的结果，-2是第二次输出的结果。我现在比较的HF值 |
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2014-03-20 10:35:37, 798.24 K
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1、溶剂化关键词是scrf，你的第一步的作用是得到初始猜么？考虑到你第二步也并没有用很昂贵的算法和基组，我觉得你初始结构不是太差的情况下可以直接用第二步来算，那scrf就加在第二步里。 scrf=（solvent=,.........）具体的你去查高斯手册scrf关键词，里面有很详细的例子。 另外如果有对称性的话可以加nosymm来取消对称性，这样一来算出来的结构基本就是能量最小的那个了。 2、我觉得溶剂应该是用产生反式结构稳定的那个溶剂，当然这个只是我觉得。。。 3、溶剂化能量的分析论坛里很多老贴，随便搜一搜“scrf能量求助”之类的就有了 |
2楼2014-03-20 11:50:09
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