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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 加入溶剂化模型后ΔG变化太大
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beipiao616

金虫 (小有名气)

[求助] 加入溶剂化模型后ΔG变化太大

我计算的体系中包含的原子有C、H、O、S、F、Ti，我是在用小基组优化、频率分析找到能量最小点后用大基组进行单点能计算，单点能计算加入了溶剂化模型IEFPCM，半径为radii=UFF。反应的方程为A+B=C+D，我先用频率分析后的G计算了一次ΔG，然后又用单点能计算的Gsol计算了一次ΔGsol，结构ΔG与ΔGsol居然相差了1000kJ/mol，麻烦给为高手帮忙分析一下，产生这种情况可能是什么原因呢？跟模型或者radii的选择有关吗？
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荆棘鸟
1楼 2012-03-15 14:36:02
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-17 18:55:50
相差1000KJ/mol？高的有点离谱了吧。。是不是算错了，呵呵。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2012-03-15 14:51:22
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chunhui201

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
beipiao616: 金币+10, ★有帮助, 哦，这样啊，那麻烦你能说的详细点吗？Ggas和Esol、Egas分别指那一部分啊？我要用的是G。谢谢啦！ 2012-03-17 16:40:38
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =   -4075.583949
这个其实是E, 不是G，你要和气相下的E比较，不能和气相下的G比较，Gsol=Ggas+(Esol-Egas)
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10楼2012-03-17 02:51:00
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chunhui201

银虫 (小有名气)
不好意思，刚看到你的回帖，
Gsol=Ggas+(Esol-Egas)
Ggas,Egas就不说了，Esol 就是g03情况下 PCM 计算中Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =   -4075.583949 此项
如果用g09计算， SMD 模型直接就包含了all non electrostatic terms 校正，你直接用得到的SCF能量就是Esol
Gsol，用气相下的Ggas校正 ，Gsol=Ggas+(Esol-Egas)
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14楼2012-03-26 23:21:04
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普通回帖

beipiao616

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangmt at 2012-03-15 14:51:22:
相差1000KJ/mol？高的有点离谱了吧。。是不是算错了，呵呵。

两个数分别是拿Sum of electronic and zero-point Energies=          -4073.376161
Sum of electronic and thermal Energies=             -4073.312535
Sum of electronic and thermal Enthalpies=           -4073.311591
Sum of electronic and thermal Free Energies=        -4073.473125
里最后一行的自由能和
                     (a.u.) =   -4075.174079
                     (a.u.) =   -4075.656539
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =   -4075.583949
最后一行的总自由能算的，应该没有错啊，这个我已经对照好几次了~
感觉不对才来这儿求助的。
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荆棘鸟
3楼2012-03-15 15:07:03
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-17 18:56:25
你的gaussian是03还是09？这两个版本溶剂化是不一样的。
你的任务栏是怎么写的？你也没贴出来。
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beipiao616
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2012-03-15 16:27:21
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beipiao616

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
送鲜花一朵
小红豆: 金币+20, 奖励回帖 2012-03-16 20:37:26
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2012-03-15 16:27:21:
你的gaussian是03还是09？这两个版本溶剂化是不一样的。
你的任务栏是怎么写的？你也没贴出来。

我的Gaussian是03的，我溶剂化单点能的计算任务栏如下
# B3LYP GEN 5D pseudo=read guess=huckel iop(1/8=1) scrf=(iefpcm, read) temp=298.15
然后再分子描述完了后加上radii=UFF，您觉得我的命令有什么问题吗？
注：麻烦您回答问题的时候应助一下，这样我就可以把金币给您啦，呵呵~
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荆棘鸟
5楼2012-03-15 16:32:56
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beipiao616

金虫 (小有名气)
自己来顶一下吧~
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荆棘鸟
6楼2012-03-16 08:38:10
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wenxianliu

金虫 (小有名气)
★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-17 18:56:39
你是不是比较的绝对能量，比较绝对能量是没有意义的，要比较相对能量。
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7楼2012-03-16 11:45:14
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beipiao616

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by wenxianliu at 2012-03-16 11:45:14:
你是不是比较的绝对能量，比较绝对能量是没有意义的，要比较相对能量。

谢谢回复。我比较的是相对能量啊
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荆棘鸟
8楼2012-03-16 13:39:40
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hlq3175

木虫 (正式写手)
Cavitation energy               
Dispersion energy                     
Repulsion energy                        
Total non electrostatic                  这几项的和，才是溶剂化自由能吧？
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9楼2012-03-16 23:16:36
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