【答案】应助回帖

荆棘鸟

11楼2012-03-17 17:13:14

hlq3175

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11楼: Originally posted by beipiao616 at 2012-03-17 17:13:14:
是吗？那样得出的结果很小啊！

他们的单位都是kcal/mol，结果够大了吧，我看的文献上有那样说的。

12楼2012-03-17 21:08:06

beipiao616

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10楼: Originally posted by chunhui201 at 2012-03-17 02:51:00:
Total free energy in solution:
with all non electrostatic terms (a.u.) = -4075.583949
这个其实是E, 不是G，你要和气相下的E比较，不能和气相下的G比较，Gsol=Ggas+(Esol-Egas)

我还是觉得你说的好像不对，Total free energy 不就是总自由能吗？

荆棘鸟

13楼2012-03-22 10:39:38

chunhui201

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不好意思，刚看到你的回帖，
Gsol=Ggas+(Esol-Egas)
Ggas,Egas就不说了，Esol 就是g03情况下 PCM 计算中Total free energy in solution:
with all non electrostatic terms (a.u.) = -4075.583949 此项
如果用g09计算， SMD 模型直接就包含了all non electrostatic terms 校正，你直接用得到的SCF能量就是Esol
Gsol，用气相下的Ggas校正，Gsol=Ggas+(Esol-Egas)

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14楼2012-03-26 23:21:04

beipiao616

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14楼: Originally posted by chunhui201 at 2012-03-26 23:21:04:
不好意思，刚看到你的回帖，
Gsol=Ggas+(Esol-Egas)
Ggas,Egas就不说了，Esol 就是g03情况下 PCM 计算中Total free energy in solution:
with all non electrostatic terms (a.u.) = -4075.583 ...

有一位虫友给我介绍了一篇文章Comment on the Correct Use of Continuum Solvent Models dx.doi.org/10.1021/jp107136j，里面的那个公式2，3推算出的计算式差不多跟您说的符合，但是作者不认为他是E或G，而是认为他是（(Esoln+Gnes)）之和。麻烦请问一下您的这种算法出于那些文献呢？十分感谢！

荆棘鸟

15楼2012-03-27 10:52:13

boylc789

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15楼: Originally posted by beipiao616 at 2012-03-27 10:52:13:
有一位虫友给我介绍了一篇文章Comment on the Correct Use of Continuum Solvent Models dx.doi.org/10.1021/jp107136j，里面的那个公式2，3推算出的计算式差不多跟您说的符合，但是作者不认为他是E或G，而是认为 ...

期待高手解答下溶剂化模型的输入及能量怎么看

有种相遇叫缘分；有种责任叫承诺；有份心情叫思念；有种痛苦叫煎熬；有种后悔叫错过；有种等待叫守候。

16楼2012-03-31 10:26:09

boylc789

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这篇文章作者说计算溶剂化自由能是要用方程4吗，有点晦涩没看懂
麻烦解答下

有种相遇叫缘分；有种责任叫承诺；有份心情叫思念；有种痛苦叫煎熬；有种后悔叫错过；有种等待叫守候。

17楼2012-03-31 13:42:22

kathy2008

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【答案】应助回帖

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15楼: Originally posted by beipiao616 at 2012-03-27 11:52:13
有一位虫友给我介绍了一篇文章Comment on the Correct Use of Continuum Solvent Models dx.doi.org/10.1021/jp107136j，里面的那个公式2，3推算出的计算式差不多跟您说的符合，但是作者不认为他是E或G，而是认为他 ...

请问这文献中公式4最后那一项，也就是thermal correction to the free energy of the solute in the gas phase是怎么确定呢？谢谢。

18楼2012-05-31 14:30:05