应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问Gauss中溶剂化的计算怎样指定溶剂
81/1返回列表
查看: 5317  |  回复: 7
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

kaluoyi2008

铁虫 (正式写手)

[求助] 请问Gauss中溶剂化的计算怎样指定溶剂已有1人参与

刚开始学用Gauss计算溶液中的模型，摸索看了那个exploring chemistry后，
觉得那一章中溶剂化效应都是指定溶剂的吧，而且只有水，乙睛几种，
我现在的溶剂是离子液体，也不知道能不能算，还是只要输入溶剂的介电常数后，什么溶剂都能够算的呢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2012-02-13 20:19:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wolfzhong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
kaluoyi2008(金币+2): ★★★很有帮助 多谢啦！ 2012-02-21 13:34:25
可以，IEFPCM就合适离子型溶液，具体见help。
给个直接的例子：
SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight  （这里DMSO和我想模拟的离子溶液接近）

SCFVAC （真空中用HF方法）
IONIC（Performs a PCM calculation for ionic solution according to the IEF-PCM formalism.）
RADII=UAHF （radii optimized for the HF/6-31G(d) level of theory ）
TSARE=0.3 （Set the average area of the tesserae generated on each sphere in the cavity surface）
TABS=353 （绝对温度 K）
TSNUM=240 （每个分子表面的划分成多少小块）
EPS=13 （介电常数）
DENSITY=0.003883 （溶液密度）
VMOL=154.37  （溶剂的摩尔体积）
RSOLV=2.83  （溶剂分子的半径）
DISM=6.45 （离子强度，根据体系设定）

这里引入一些宏观物理量的目的是：使得你模拟的情况和真实体系接近。譬如你其他参数对了，但你的溶液的密度or离子强度不对都会给结果带来一定的误差。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-02-14 03:19:02
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

604758762

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2012-02-14 03:19:02:
可以，IEFPCM就合适离子型溶液，具体见help。
给个直接的例子：
SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight  （这里DMSO和我想模拟的离子溶液接近）

SCFVAC （真空中用HF方法）
IONIC（Performs a PCM cal ...

这个里面的参数也要写在高斯的命令里面吗？
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-14 09:13:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
kaluoyi2008(金币+2): ★★★很有帮助 多谢啦！ 2012-02-21 13:34:34
是的 也写进GAUSSIAN的输入文件中，具体对应某种溶剂的参数的话在高斯说明书的溶剂模型里有的，你可以看看~
赞一下 回复此楼
4楼2012-02-14 10:48:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaluoyi2008

铁虫 (正式写手)
wolfzhong，十分感谢您上次的回复，可怜我这么长时间还是没搞定溶剂化这一块的计算，现在我还想请教几个问题：
1，关键词 SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) ，这个Solvent如果不出现，是不是默认的就是水
2，在你的例子中虽然指定的是DMSO，只是因为DMSO是一种gauss中提供的溶剂，因为接近你需要模拟的溶剂所以在用DMSO代替，然后用read读入需要模拟溶剂的一系列参数。这么说我也可以用Solvent选择一种程序中接近的溶剂l来代替想要模拟的真实体系，然后用read修改参数是吗？
3，在例子最后指定的一系列参数，是否都必须输入实验值，如果不输入的话，是否都是默认Solvent=溶剂的数值。
盼您赐教，感激不尽啊~~~
赞一下 回复此楼
5楼2012-05-15 14:43:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by kaluoyi2008 at 2012-05-15 14:43:46
wolfzhong，十分感谢您上次的回复，可怜我这么长时间还是没搞定溶剂化这一块的计算，现在我还想请教几个问题：
1，关键词 SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) ，这个Solvent如果不出现，是不是默认的就是水
2，在你 ...

楼主你好，最近我刚刚接触高斯，计算加溶剂的，看到你的这个帖子，我也仔细的想了想，我想在咨询一下你。
1：溶剂如果在高斯守则中能查到，比如说苯是不是scrf=(slovent=toluene)。
2：如果再scrf中不写slovent，默认的是水是吧，但是如果没写solvent但是有read这个，说明溶剂是从文件的末尾读入的是吧，比如说scrf=(read)   文件的末尾写上溶剂的参数，和2楼说的一样。这样就能指定高斯中没有定义的溶剂了是吧？
3：我想问问，如果说使用高斯中没有的溶剂，利用上面说的方法就行，但是我想给他个名字，是不是可以这样写：scrf=(read,solvent=i love you),这样是不是定义了一个iloveyou的溶剂。参数我们在后面自己输入？
谢谢你，期待你的回答
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
6楼2014-07-06 21:10:56
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 604758762 at 2012-02-14 09:13:37
这个里面的参数也要写在高斯的命令里面吗？...

参数好像是写在文件的末尾，在坐标输入结束后空一行，就写参数，参数的结束标志是，在一个空行，我自己觉得是这样
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
7楼2014-07-06 21:12:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2012-02-14 03:19:02
可以，IEFPCM就合适离子型溶液，具体见help。
给个直接的例子：
SCRF=(IEFPCM,Read,Solvent=DMSO) SCF=tight  （这里DMSO和我想模拟的离子溶液接近）

SCFVAC （真空中用HF方法）
IONIC（Performs a PCM calcu ...

解释的好
回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
8楼2014-07-06 21:13:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kaluoyi2008 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭