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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯溶剂化能求助
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老猫晒太阳

金虫 (初入文坛)

[求助] 高斯溶剂化能求助 已有1人参与

本人新手，因为化合物C12H12N2O3，有顺反异构，导师突然要求用高斯计算，但是关于量子化学的知识一点儿也没有，最近发文在即，比较急切。
先简单说一下我现在用的方法
我用的是gaussain03W的软件，之前用的是结构优化，分两步，第一步是hf/3-21g opt，然后第二步是# B3LYP/6-31G* opt geom=checkpoint guess=checkpoint freq pop=(reg ,nbo)，这是早前毕业的师兄摸索的。
由于做了单晶，发现反式为主，所以理应是反式稳定，结果计算结果都是顺式稳定，所以我猜想可能是因为没有考虑溶剂的原因。
问题如下：
1、我应该用什么命令语句，且这个命令在第几步的使用。(希望能全部写给我，我真是一点儿不会，尝试了几个，结果运行之后秒停，崩溃了)
2、计算溶剂能的时候，选用哪个溶剂？我这个化合物正好有个单晶，是在丙酮和石油醚的情况下培养得到的，单晶显示有异构体，反式为主。同时核磁是氢谱用氯仿打的，核磁碳谱是DMSO打的，那我在选择溶剂的时候，solvent=?
3、如果最后计算完毕，我应该看哪个数值来判断哪个异构体更稳定呢？

求各位帮帮忙，如果需要附我的相关结果，我可以附上。下面先贴两个哈。
5-h-a是反式，5-h-c是顺式，-1是第一次输出的结果，-2是第二次输出的结果。我现在比较的HF值
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1楼 2014-03-20 10:37:48
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
老猫晒太阳: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-03-20 12:09:40
1、溶剂化关键词是scrf，你的第一步的作用是得到初始猜么？考虑到你第二步也并没有用很昂贵的算法和基组，我觉得你初始结构不是太差的情况下可以直接用第二步来算，那scrf就加在第二步里。
scrf=（solvent=,.........）具体的你去查高斯手册scrf关键词，里面有很详细的例子。
另外如果有对称性的话可以加nosymm来取消对称性，这样一来算出来的结构基本就是能量最小的那个了。

2、我觉得溶剂应该是用产生反式结构稳定的那个溶剂，当然这个只是我觉得。。。

3、溶剂化能量的分析论坛里很多老贴，随便搜一搜“scrf能量求助”之类的就有了
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2楼2014-03-20 11:50:09
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老猫晒太阳

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-03-20 11:50:09
1、溶剂化关键词是scrf，你的第一步的作用是得到初始猜么？考虑到你第二步也并没有用很昂贵的算法和基组，我觉得你初始结构不是太差的情况下可以直接用第二步来算，那scrf就加在第二步里。
scrf=（solvent=,...... ...

1、我尝试过
#opt freq b3lyp/6-31+g** scrf(read,pcm,sovlent=actone)
geom=connectivity
和
#opt freq hf/6-31+g** scrf(read,pcm,solvent=acetone)
geom=connectivity
这两个都是看着别人这么写，就尝试运行一下的，但是试了之后都马上出错了，2070错误。
2、可是我的三种溶剂里都是顺反同时出现，碳谱没有定量，看不出比例，氢谱的话比例大概是2:3，当然看不出哪个
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3楼2014-03-20 12:14:12
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 老猫晒太阳 at 2014-03-20 12:14:12
1、我尝试过
#opt freq b3lyp/6-31+g** scrf(read,pcm,sovlent=actone)
geom=connectivity
和
#opt freq hf/6-31+g** scrf(read,pcm,solvent=acetone)
geom=connectivity
这两个都是看着别人这么写，就尝试运 ...

1、那是由于你只是copy别人的，对其中的各个关键词的具体意义不明造成的，比如read，还需要你额外输入控制pcm的选项，等等。
     所以我的建议是你去看下高斯手册中scrf这一章的内容，里面可以说是对于各方面都解释得很详细了，如何使用关键词，如果分析能量等等。

2、如果是这种情况，那你3种溶剂都做一下吧
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4楼2014-03-20 12:25:53
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