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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于Vasp TST Tools的NEB计算中的SS NEB计算问题
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wangjiang12

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于Vasp TST Tools的NEB计算中的SS NEB计算问题已有1人参与

各位高手好，

我最近想用Vasp TST Tools中的NEB计算来算Ti 的bcc转变为hcp的过程，但是该转变前后晶胞的体积会发生变化。我查到也许可以设置LNEBCELL=TRUE来实现。我有几个问题如下：
1. 我用nebmake.pl 插出中间态后，它有个提醒，WARNING: LATTICE CONSTANTS ARE NOT THE SAME ，我记得neb计算需要初态晶胞和末态晶胞的MASS中心一致，不太理解这是什么意思。
2. 如果用LNEBCELL=TRUE，同时需要设置IOPT=3，但是这是个粗略的快速算法，如果要精确点，是不是等这步算完后再设置LNEBCELL=False（这时候晶胞体积不变）, IOPT=2或者1再算一遍呢？ IOPT=2和1选择哪个比较好呢？

如果有什么比较好的材料可以推荐给我阅读就更好了。

非常感谢
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1楼2014-03-15 16:54:41
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-03-16 17:54:10
WARNING: LATTICE CONSTANTS ARE NOT THE SAME
這�?息說明了你初态晶胞和末态晶胞的晶格不一致
你可以簡查你的初态晶胞和末态晶胞結構檔前五行
是否"一模一樣"
(印象中至少每個數字的小數點後十位數要一樣)
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2楼2014-03-16 06:49:46
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wangjiang12

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-03-16 06:49:46
WARNING: LATTICE CONSTANTS ARE NOT THE SAME
這�?息說明了你初态晶胞和末态晶胞的晶格不一致
你可以簡查你的初态晶胞和末态晶胞結構檔前五行
是否"一模一樣"
(印象中至少每個數字的小數點後十位數要 ...

初态晶胞和末态晶胞的晶格应该要不一样的，bcc结构和hcp结构不太可能做到晶格一样的吧，就是因为晶格不一样，所以我要用ss neb办法，改变中间images的晶格。我的问题是这样应该不会有问题吧。还有就是具体实施方案。谢谢
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3楼2014-03-16 10:15:20
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangjiang12 at 2014-03-16 10:15:20
初态晶胞和末态晶胞的晶格应该要不一样的，bcc结构和hcp结构不太可能做到晶格一样的吧，就是因为晶格不一样，所以我要用ss neb办法，改变中间images的晶格。我的问题是这样应该不会有问题吧。还有就是具体实施方案 ...

但你想要用 nebmake.pl
這個程式就是用在初态晶胞和末态晶胞的晶格一樣的情況
也就是你現在想做的 BCC HCP transition
nebmake.pl 是幫不上忙的
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4楼2014-03-16 16:45:15
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wangjiang12

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jpchou at 2014-03-16 16:45:15
但你想要用 nebmake.pl
這個程式就是用在初态晶胞和末态晶胞的晶格一樣的情況
也就是你現在想做的 BCC HCP transition
nebmake.pl 是幫不上忙的...

nebmake.pl是可以用的,只是有个warning而已，你可能不太了解ss-neb，那个可以改变中间态体积的
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5楼2014-03-17 10:43:40
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangjiang12 at 2014-03-17 10:43:40
nebmake.pl是可以用的,只是有个warning而已，你可能不太了解ss-neb，那个可以改变中间态体积的...

真的耶
剛試了一下~
這�?息的確只是 warning
nebmake.pl 仍然會將結果輸出
嗯~是我弄錯了~真是抱歉
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6楼2014-03-17 13:28:24
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wangjiang12

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jpchou at 2014-03-17 13:28:24
真的耶
剛試了一下~
這�?息的確只是 warning
nebmake.pl 仍然會將結果輸出
嗯~是我弄錯了~真是抱歉...

以后可以多交流交流，你是硕士生还是博士生啊
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7楼2014-03-17 14:14:04
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18796262890

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangjiang12 at 2014-03-16 10:15:20
初态晶胞和末态晶胞的晶格应该要不一样的，bcc结构和hcp结构不太可能做到晶格一样的吧，就是因为晶格不一样，所以我要用ss neb办法，改变中间images的晶格。我的问题是这样应该不会有问题吧。还有就是具体实施方案 ...

请问大神，用NEB的话是不是需要需要在vasp上进行编译？
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8楼2017-09-24 21:59:33
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