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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp计算过渡态问题
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dfjk-123

新虫 (小有名气)

[求助] vasp计算过渡态问题

各位大侠：
我最近用vasp 5.2计算过渡态，共设置了8个插值点，02和08优化得很快，但它们收敛后，别的点就不再跑了。请问这是什么原因？
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1楼2012-03-21 08:57:53
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liuqun

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
WDD880227: 金币+2, 感谢您的详细回帖 2012-05-08 14:09:47
引用回帖:
8楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-07 10:13:59:
这个我也很想知道

你现在运行vasp是用几个节点？
IMAGES= number of images
设置image的个数，注意节点数一定要能被images数整除。Vasp将节点分成images个组，第一个组从01子目录中读取POSCAR，以此类推，第二个组从02子目录下读取POSCAR。 一定要固定两端点（Endpoint），而EndPoints放在00 和XX子目录中，（XX=number of images+1）所有的输出文件都放在子目录中，因为vasp没有在00 和XX子目录下执行，所以没有输出文件产生。我现在已经可以运算了，不知道我说的详细不详细。
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9楼2012-05-08 12:55:45
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likai0106

金虫 (小有名气)
★
fzx2008: 金币+1, 鼓励交流 2012-03-22 09:12:29
不再跑是什么情况？是02和08算完就停止了还是其他的都收敛不了啊？
楼主用的是vasp自带的NEB还是后编译进去的那个啊？
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2楼2012-03-21 14:55:13
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dfjk-123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-03-21 14:55:13:
不再跑是什么情况？是02和08算完就停止了还是其他的都收敛不了啊？
楼主用的是vasp自带的NEB还是后编译进去的那个啊？

不再跑是指02和08算完程序在空跑，但是没有任何输出了，02和08用了三个小时就收敛了，程序从那以后三天都没有更新过，所有文件都是三天前更新的，但检查了一下，进程还在。我是用的vasp自带的NEB算的。谢谢
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3楼2012-03-21 16:12:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖交流！ 2012-03-22 09:12:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by dfjk-123 at 2012-03-21 16:12:38:
不再跑是指02和08算完程序在空跑，但是没有任何输出了，02和08用了三个小时就收敛了，程序从那以后三天都没有更新过，所有文件都是三天前更新的，但检查了一下，进程还在。我是用的vasp自带的NEB算的。谢谢

检查一下每个image中的输出文件OSZICAR确定有没有那种电子步不收敛的情况，主要看有没有那种能量超过E6或者E8的（10的6次方或8次方的）。
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4楼2012-03-22 08:52:16
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dfjk-123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by likai0106 at 2012-03-22 08:52:16:
检查一下每个image中的输出文件OSZICAR确定有没有那种电子步不收敛的情况，主要看有没有那种能量超过E6或者E8的（10的6次方或8次方的）。

没有这种情况，数量级都在E3~E4，我的电子步收敛标准设置的是10-4，离子步优化收敛标准是10-3，会与这个有关系吗？
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5楼2012-03-22 10:06:05
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-03-22 14:26:01
引用回帖:
5楼: Originally posted by dfjk-123 at 2012-03-22 10:06:05:
没有这种情况，数量级都在E3~E4，我的电子步收敛标准设置的是10-4，离子步优化收敛标准是10-3，会与这个有关系吗？

你在调整一下你的images吧，vasp会默认认为能量到达一定的值就不收敛了，然后一直处于运行状态但是不会输出的。这个值我也忘记是什么忘记是E6还是什么了，你再调整一下你的images比如有没有提示原子过近的。
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6楼2012-03-22 14:20:09
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liuqun

木虫 (小有名气)
你好，我刚要用VASP找过渡态，但是我不知道怎么准备输入文件，我有00 ，01......07个POSCAR，是在每个文件夹下都有INCAR,POTCAR,KPOINT呢，还是在7个文件夹外有这三个输入文件就行了，请指教一下我，我将不胜感激
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7楼2012-04-21 22:13:01
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuqun at 2012-04-21 22:13:01:
你好，我刚要用VASP找过渡态，但是我不知道怎么准备输入文件，我有00 ，01......07个POSCAR，是在每个文件夹下都有INCAR,POTCAR,KPOINT呢，还是在7个文件夹外有这三个输入文件就行了，请指教一下我，我将不胜感激

这个我也很想知道
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8楼2012-05-07 10:13:59
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by liuqun at 2012-05-08 12:55:45:
你现在运行vasp是用几个节点？
IMAGES= number of images
设置image的个数，注意节点数一定要能被images数整除。Vasp将节点分成images个组，第一个组从01子目录中读取POSCAR，以此类推，第二个组从02子目录下读 ...

我想问问 我是设置了images=4
然后用nebmake.pl生成了00 01 02 03 04 05这些文件夹
然后我将这些文件夹与INCAR POTCAR KPOINTS放在一起进行计算
但是发现我的计算开始后只有01 02 两个文件夹有输出文件
03 04这两个文件夹中还是只存在POSCAR这一个文件 这是为什么呐？
能帮我看看吗？ 谢谢你

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10楼2012-05-08 13:09:07
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