应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】重金求助vasp 算过渡态 80 金币
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
701/7返回列表123456下一页末页
查看: 3087  |  回复: 69
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chuchu6816

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】重金求助vasp 算过渡态 80 金币 已有14人参与

请问各位怎么用vasp CNEB算过渡态？反应物，产物结构只是线性变化时，通过vasp里面的小程序线性截取几个结构，可以优化出过渡态。但是一旦反应物跟产物的结构相差的比较大，便很难找到相应的过渡态。请问各位高手是怎么处理这种情况的？另外，找到过渡态后，怎么算频率，算完频率后，怎么分析相应的虚频？证明所优化的过渡态是正确的？ 若有研究分子筛的同行，能否帮我算一个例子，例如：CH3OH 在CHA 上形成相应的烷氧。 若哪位高手能帮忙解决问题，本人将重金感谢！谢谢！！
再次恳求各位的帮忙！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-06-24 16:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

condensed

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
hedaors(金币+1):thanks 2010-06-24 16:55:40
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-24 17:33:54
过渡态一定对应虚频么.这个显然是不一定的.再说用NEB找过渡态一定对么,也是不一定的.个人倾向与用分子动力学做这样研究.

哥们,这种严格的寻找过渡态的方法有.不过算一个简单体系(如CO2)用200+cpu需要半年的时间...

[ Last edited by condensed on 2010-6-24 at 18:57 ]
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2010-06-24 16:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuchu6816

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by condensed at 2010-06-24 16:38:50:
过渡态一定对应虚频么.这个显然是不一定的.再说用NEB找过渡态一定对么,也是不一定的.个人倾向与用分子动力学做这样研究.

哥们,这种严格的寻找过渡态的方法有.不过算一个简单体系(如CO2)用200+cpu需要半年的时间 ...

用虚频来检查过渡态是量化计算里最长用的方法，并且已经发了很多文章。在gaussian 密度泛函 里面最常见。现在我想用VASP试一下。对于初始物 与产物变化较大的体系总是找不到一个合适的过渡态。但是的确很多人做出来了，并且在发文章。就是不知道别人是怎么做的。
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 22:21:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

condensed

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-25 07:41:45
引用回帖:
Originally posted by chuchu6816 at 2010-06-24 22:21:00:


用虚频来检查过渡态是量化计算里最长用的方法，并且已经发了很多文章。在gaussian 密度泛函 里面最常见。现在我想用VASP试一下。对于初始物 与产物变化较大的体系总是找不到一个合适的过渡态。但是的确很多人 ...

的确是很多人做出来.做吸附的比较多.建个表面,让想吸附的东西一步步的接近表面就好了.

虚频问题.如果这个过渡态是动力学稳定的话是不可能出现虚频的.
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-06-24 22:49:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stractor

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-06-25 07:41:28
过渡态一定有一个频率是虚的。你要用VASP研究化学反应，我没见过文献，如果楼主见到过用VASP研究化学反应的文章，麻烦你说一下是那篇文章。VASP用NEB研究扩散的过程倒很多。你所说的研究内容个人觉得用Gaussian可以。此外VASP计算频率设置IBRION=5。

[ Last edited by stractor on 2010-6-24 at 23:00 ]
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-06-24 22:57:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuchu6816

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-06-24 22:57:48:
过渡态一定有一个频率是虚的。你要用VASP研究化学反应，我没见过文献，如果楼主见到过用VASP研究化学反应的文章，麻烦你说一下是那篇文章。VASP用NEB研究扩散的过程倒很多。你所说的研究内容个人觉得用Gaussian可 ...

J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2799-2809

J. Phys. Chem. B 2003, 107, 1309-1315
gaussian是可以，但是对周期性模型却不行。而vasp 确实周期性模型很好的方法，现在我想尝试下用vasp 的CNEB算下过渡态试下。
赞一下 回复此楼
6楼2010-06-25 08:58:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
囧，VASP研究化学反应的文献成千上万，到处都是。。。
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-06-25 14:37:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！鼓励发有价值的话题！ 2010-06-25 15:26:50
反应物 产物相差比较大，建议用dimer方法。
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-06-25 14:39:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-06-26 08:36:02
引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2010-06-25 14:39:32:
反应物 产物相差比较大，建议用dimer方法。

也不尽然，头尾差别较大，也可以考虑是否有中间产物呀.......
如果硬是要找，多插几个image就是了.....
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2010-06-25 17:16:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hakuna at 2010-06-25 17:16:01:


也不尽然，头尾差别较大，也可以考虑是否有中间产物呀.......
如果硬是要找，多插几个image就是了.....

多插image当然是可以，就是比较费时间。
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2010-06-25 17:53:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chuchu6816 的主题更新
701/7返回列表123456下一页末页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 292分，材料与化工，申请调剂 +22 程晴之 2026-04-01 26/1300 2026-04-04 22:03 by hemengdong
[考研] 0835学硕299求调剂 08大类可接受 +5 useryy 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:07 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +3 农业工程与信息� 2026-04-04 3/150 2026-04-04 12:19 by 舍而后得
[考研] 0856调剂 +8 曲听筠 2026-03-30 8/400 2026-04-04 08:46 by tianyyysss
[考研] 275求调剂 +14 waltzh 2026-04-01 14/700 2026-04-03 11:24 by qqq850810
[考研] 08工科275分求调剂 +14 AaAa7420 2026-03-31 14/700 2026-04-03 11:13 by cocolv
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-04-02 3/150 2026-04-03 08:44 by yulian1987
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:08 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[考研] 377求调剂 +3 RASKIN 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:45 by zzchen2000
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 化学工程专硕324分，一志愿中国矿业大学求调剂 +7 耿耿1314 2026-04-01 7/350 2026-04-02 07:40 by 尚水阁主
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 080200学硕，机械工程专业277分，求带走！ +4 瓶子PZ 2026-03-31 4/200 2026-03-31 20:16 by vgtyfty
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +6 hanamiko 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:35 by hypershenger
[考研] 生物考研337分求调剂 +4 cgxin 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:18 by 记事本2026
[考博] 材料专业申博 +5 杜雨婷dyt 2026-03-29 5/250 2026-03-31 11:19 by oooqiao
[考研] 370求调剂 +3 080700调剂 2026-03-30 3/150 2026-03-31 01:09 by A_Zhe
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭