应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】新手求助vasp计算氧分子结合能的问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
131/2返回列表12下一页
查看: 4198  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jttjtl

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】新手求助vasp计算氧分子结合能的问题 已有4人参与

本人刚学vasp，最近用vasp计算了氧原子和氧分子的总能，然后再计算了一下结合能，大小为6.48eV，比实验上的5.2eV大不少，想请大家帮忙看看我的计算有没有问题~
以下是我计算总能时的INCAR文件：
ENCUT = 400
GGA = PE
ISMEAR = 0
ISIF = 0
NSW = 0
EDIFF = 1E-05
LREAL = .FALSE.
LDIAG=.TRUE.
PREC=Accurate
NELMDL=5
ISPIN=2
NUPDOWN=2

以下是氧原子的POSCAR：
SYSTEM
1.000000
15.000000000000000       0.0000000000000000       0.0000000000000000
0.0000000000000000       15.000000000000000       0.0000000000000000
0.0000000000000000       0.0000000000000000       15.000000000000000
O
1
Direct
   7.5000000000000000   7.5000000000000000   7.500000000000000

氧分子直接是取了课本中的健长1.208A，然后放到15*15*15的盒子里面的；
氧分子的POSCAR：
1.000000
15.00000000000000      0.000000000000000      0.000000000000000
0.000000000000000      15.00000000000000      0.000000000000000
0.000000000000000      0.000000000000000      15.00000000000000
O
2
Direct
   7.5000000000000000   7.5000000000000000   7.5000000000000000
   8.5805000000000007   7.5000000000000000   7.5000000000000000

KPOINTS均为：
KPOINTS
0
gamma
1  1  1
0. 0. 0.

计算出来的结果是：
氧原子的总能：
  free energy    TOTEN  =        -1.67175867 eV

  energy without entropy =       -1.51749635  energy(sigma->0) =       -1.59462751

氧分子的总能：

  free energy    TOTEN  =        -9.82983769 eV

  energy without entropy =       -9.82983769  energy(sigma->0) =       -9.82983769
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

枫魔馨

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-10-11 09:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★
jttjtl(金币+5):谢谢提醒~ 2010-10-11 15:15:53
zxzj05(金币+1):奖励 2010-10-11 20:46:01
坐标错了,
D 为分数坐标,
赞一下(2人) 回复此楼
由天命,成人事！
3楼2010-10-11 12:15:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

vaspnew

金虫 (小有名气)
★
jttjtl(金币+2): 2010-10-11 15:17:16
zxzj05(金币+1):奖励 2010-10-11 20:45:52
计算氧分子的时候应该让原子驰豫吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-10-11 12:05:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jttjtl

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lono75 at 2010-10-11 12:15:42:
坐标错了,
D 为分数坐标,

哦，发现了，的确写错了sweat:~
不过貌似不影响结果，这是氧原子的OUTCAR中的原子位置
position of ions in fractional coordinates (direct lattice)
   0.50000000  0.50000000  0.50000000
   0.58050000  0.50000000  0.50000000

position of ions in cartesian coordinates  (Angst):
   7.50000000  7.50000000  7.50000000
   8.70750000  7.50000000  7.50000000:
赞一下 回复此楼
4楼2010-10-11 15:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jttjtl

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by vaspnew at 2010-10-11 12:05:10:
计算氧分子的时候应该让原子驰豫吧

计算总能应该不用驰豫吧？
赞一下 回复此楼
5楼2010-10-11 15:17:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
zxzj05(金币+1):奖励 2010-10-11 20:46:13
要弛豫，不然得不到能量的基态。计算出的键长与实验值总是有偏差
赞一下(1人) 回复此楼
心之所向无惧无悔
6楼2010-10-11 15:42:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):奖励 2010-10-11 20:46:39
jttjtl(金币+3): 2010-10-20 10:14:37
必须要弛豫。
回复此楼
7楼2010-10-11 16:41:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vaspstudy

银虫 (小有名气)
★
jttjtl(金币+5): 2010-10-11 19:15:24
zxzj05(金币+1):奖励 2010-10-11 20:46:26
jttjtl(金币+5): 2010-10-12 08:37:23
引用回帖:
Originally posted by jttjtl at 2010-10-11 09:38:50:
本人刚学vasp，最近用vasp计算了氧原子和氧分子的总能，然后再计算了一下结合能，大小为6.48eV，比实验上的5.2eV大不少，想请大家帮忙看看我的计算有没有问题~
以下是我计算总能时的INCAR文件：
ENCUT = 400
...

下面是个人一些观点，权作交流：
（1）计算单原子能量时不需要relax，计算分子能量时最好relax；
（2）据个人试验，设置相同时，不同的赝势得到的结果可能出入比较大，如果与实验值相差太大，建议换种赝势试一下
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-10-11 17:53:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jttjtl

银虫 (小有名气)
谢谢zxzj05的提示，我换了HSE06来计算，跟实验值非常接近了，5.18eV.
赞一下 回复此楼
9楼2010-10-12 08:38:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuicui2397

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by vaspstudy at 2010-10-11 17:53:41
下面是个人一些观点，权作交流：
（1）计算单原子能量时不需要relax，计算分子能量时最好relax；
（2）据个人试验，设置相同时，不同的赝势得到的结果可能出入比较大，如果与实验值相差太大，建议换种赝势试一下...

想请教一下：
（1）不进行relax，如何计算能量？难道是只进行一步静态自洽计算的得到的能量，就是单原子的能量？
（2）计算体系的能量是看free energy TOTEN的值，还是看energy without entropy的值？
（3）所谓体系能量是relax后的能量，还是先relax再静态自洽计算后的能量？
有点不确定以上问题，请不吝赐教。
赞一下 回复此楼
10楼2014-04-10 10:50:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jttjtl 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 285求调剂 +7 AZMK 2026-04-04 10/500 2026-04-06 12:02 by AZMK
[考研] 求助071001调剂！！！ +4 黄守松 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:55 by 1028907439
[考研] 材料与化工专硕306分找合适调剂 +6 沧海轻舟e 2026-04-06 6/300 2026-04-06 10:02 by lqwchd
[考研] 调剂 一志愿吉林大学357分 +5 .Starry. 2026-04-04 5/250 2026-04-06 09:28 by cql1109
[考研] 372分，材料与化工，一志愿湖南大学，求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-01 3/150 2026-04-06 09:04 by 无际的草原
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +11 梁富贵险中求 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:24 by houyaoxu
[考研] 285求调剂 +4 恶法大二的气味� 2026-04-05 5/250 2026-04-05 20:32 by 286640313
[考研] 一志愿同济大学323分（080500）求调剂 +8 yikeniu 2026-04-01 8/400 2026-04-05 18:15 by cql1109
[考研] 323分（计算机视觉和大模型项目）能直接上手 +3 chaoxiicy 2026-04-01 3/150 2026-04-05 00:50 by chongya
[考研] 环境285分，过六级，求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 333求调剂 +12 wfh030413@ 2026-04-03 13/650 2026-04-04 21:02 by jj987
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-03-31 5/250 2026-04-04 19:45 by 1753564080
[考研] 考研调剂 +4 zybz冲冲冲 2026-04-03 6/300 2026-04-04 13:08 by zybz冲冲冲
[考研] 278求调剂 +6 Yy7400 2026-04-03 6/300 2026-04-04 09:53 by zhangdingwa
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 334求调剂 +9 Trying] 2026-03-31 9/450 2026-04-03 15:18 by 琢珥丶
[考研] 273求调剂 +20 李芷新1 2026-03-31 20/1000 2026-04-03 09:58 by linyelide
[考研] 调剂 +7 祉岷. 2026-04-02 7/350 2026-04-03 09:11 by 花呗还欠600
[考研] 材料专业求调剂 +10 月月鸟木 2026-04-01 10/500 2026-04-02 12:57 by wxiongid
[考研] 考研调剂求助 +7 13287130938 2026-03-31 7/350 2026-03-31 16:39 by 690616278
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭