24小时热门版块排行榜    

查看: 6372  |  回复: 15

lgxyz

铜虫 (正式写手)

[交流] vasp用ci-neb算出来的过渡态有多个虚频,怎么办? 已有10人参与

各位,用vasp的ci-neb找出来的过渡态,然后用IBRION=5做频率,发现有很多虚频,请问这些虚频用不用消去,要是消去,怎么做?谢谢了!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包,谢谢回帖
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-12 16:21:47
需要尽量消去虚频,特别是这些虚频比较大的情况
9楼2012-03-12 16:18:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by hakuna at 2012-02-22 15:09:13:
很多是多少?做NEB没收敛吗?
1.把所有CONTCAR拷贝到POSCAR,重新NEB;
2.根据振动模式,调坐标消去不要的
3.采用部分优化消去不要的
多试试吧,没有固定做法

ci-neb的各个image都达到了收敛标准(-0.05)
看以前的文献用ci-neb作过渡态时就不用算频率,因为用neb这种算法得到的最高点就认为是过渡态;另外,用vasp算频率只取gamma点,本身就不是很精确。
近来的文献用neb做过渡态时都在方法里强调了过渡态的频率计算只有一个虚频,哎,我怎么算的过渡态频率就会有5,6个虚频呢?是不是算频率的方法有问题?
3楼2012-02-22 20:24:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包,谢谢回帖
liliangfang(金币+1): 鼓励交流 2012-03-12 11:08:29
问一下你算得是什么体系,要是晶体体系的话这很正常。
7楼2012-03-12 11:06:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缺心眼桌

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-03-12 16:18:07
需要尽量消去虚频,特别是这些虚频比较大的情况

您好!请问多大THz的虚频算大呢?什么数量级的可以忽略?
10楼2015-04-02 17:18:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

hakuna

木虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
fzx2008(金币+2): 谢谢指教 2012-02-22 20:38:04
很多是多少?做NEB没收敛吗?
1.把所有CONTCAR拷贝到POSCAR,重新NEB;
2.根据振动模式,调坐标消去不要的
3.采用部分优化消去不要的
多试试吧,没有固定做法
2楼2012-02-22 15:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suhuang

禁虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-03-09 08:16:40
本帖内容被屏蔽

4楼2012-03-08 23:41:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by suhuang at 2012-03-08 23:41:44:
固定一些原子,在你做出的neb图的反应方向上,一般只有一个虚频。或者你把过渡态的结构拿出来重新优化,可能是力的标准小了

谢谢 要是把过渡态拿出来重新优化 岂不是以优化就跑到反应物或产物了去了?
5楼2012-03-12 10:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

而且,neb找到过渡态做完频率计算,出现的虚频对应的振动模式不是在反应坐标上,请教这是什么原因?
6楼2012-03-12 10:44:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by dxcharlary at 2012-03-12 11:06:13:
问一下你算得是什么体系,要是晶体体系的话这很正常。

金属表面吸附分子 这种体系也正常吗?
8楼2012-03-12 12:58:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lgxyz 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:57 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +6 yfihxh 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:18 by JourneyLucky
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 279求调剂 +3 抓着星星的女孩 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:47 by userper
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +8 mingmingry 2026-03-09 9/450 2026-03-11 10:23 by 沙漠之狐994
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 0856材料与化工353分求调剂 +11 NIFFFfff 2026-03-09 11/550 2026-03-10 18:36 by suyuanhai
[考研] 一志愿山东大学,总分327,英语二79,有论文,有竞赛,已过四六级 +3 木木目目1 2026-03-09 3/150 2026-03-09 19:52 by yuningshan
信息提示
请填处理意见