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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp用ci-neb算出来的过渡态有多个虚频，怎么办？
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lgxyz

铜虫 (正式写手)

[交流] vasp用ci-neb算出来的过渡态有多个虚频，怎么办？ 已有10人参与

各位，用vasp的ci-neb找出来的过渡态，然后用IBRION=5做频率，发现有很多虚频，请问这些虚频用不用消去，要是消去，怎么做？谢谢了！
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1楼 2012-02-21 18:35:01
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包，谢谢回帖
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-12 16:21:47
需要尽量消去虚频，特别是这些虚频比较大的情况
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9楼2012-03-12 16:18:07
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by hakuna at 2012-02-22 15:09:13:
很多是多少？做NEB没收敛吗？
1.把所有CONTCAR拷贝到POSCAR，重新NEB;
2.根据振动模式，调坐标消去不要的
3.采用部分优化消去不要的
多试试吧，没有固定做法

ci-neb的各个image都达到了收敛标准（-0.05）
看以前的文献用ci-neb作过渡态时就不用算频率，因为用neb这种算法得到的最高点就认为是过渡态；另外，用vasp算频率只取gamma点，本身就不是很精确。
近来的文献用neb做过渡态时都在方法里强调了过渡态的频率计算只有一个虚频，哎，我怎么算的过渡态频率就会有5,6个虚频呢？是不是算频率的方法有问题？
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3楼2012-02-22 20:24:49
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包，谢谢回帖
liliangfang(金币+1): 鼓励交流 2012-03-12 11:08:29
问一下你算得是什么体系，要是晶体体系的话这很正常。
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7楼2012-03-12 11:06:13
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缺心眼桌

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-03-12 16:18:07
需要尽量消去虚频，特别是这些虚频比较大的情况

您好！请问多大THz的虚频算大呢？什么数量级的可以忽略？
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10楼2015-04-02 17:18:38
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普通回帖

hakuna

木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
fzx2008(金币+2): 谢谢指教 2012-02-22 20:38:04
很多是多少？做NEB没收敛吗？
1.把所有CONTCAR拷贝到POSCAR，重新NEB;
2.根据振动模式，调坐标消去不要的
3.采用部分优化消去不要的
多试试吧，没有固定做法
赞一下 回复此楼
2楼2012-02-22 15:09:13
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suhuang

禁虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-03-09 08:16:40
本帖内容被屏蔽
4楼2012-03-08 23:41:44
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by suhuang at 2012-03-08 23:41:44:
固定一些原子，在你做出的neb图的反应方向上，一般只有一个虚频。或者你把过渡态的结构拿出来重新优化，可能是力的标准小了

谢谢 要是把过渡态拿出来重新优化 岂不是以优化就跑到反应物或产物了去了？
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5楼2012-03-12 10:41:31
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
而且，neb找到过渡态做完频率计算，出现的虚频对应的振动模式不是在反应坐标上，请教这是什么原因？
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6楼2012-03-12 10:44:25
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by dxcharlary at 2012-03-12 11:06:13:
问一下你算得是什么体系，要是晶体体系的话这很正常。

金属表面吸附分子 这种体系也正常吗？
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8楼2012-03-12 12:58:48
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