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seo.d_park

木虫 (正式写手)

[求助] 关于Cloning的问题,求救啊~~已有5人参与

我在做的cloning,
我的几个mutant...Ligation,enzyme cutting 确认, sequencing, Protein expression这些都没有问题。
所以准备做Maxi prep来大量提取DNA。
但是问题就出在这儿。
之前的步骤一直是拿取的colony 在4ml LB broth培养(3ml培养,1ml做了Stock)后,Mini prep提取的DNA做的。
然后确定DNA没问题后,拿stock做 Maxi prep。
(stock是 菌液:DMSO=4:1 制作的 500ul,然后放入-80℃的freezer 冷冻保管。)
在做Maxi 时候(确认培养液浑浊后),取少量(3ml)又用restriction enzyme 切了一遍,发现没有之前(Colony提取的DNA) Insert band 明显(DNA量加到2ug才能隐约看到Insert  band,有几个根本看不到,之前用1ug 就能看到明显的insert band,我所做的Insert size 是200~700bp,restriction enzyme 前后端一起切的,用的是takara的,1ug/1ug)。
然后继续确认了Protein expression,与之前一样用了1ug 进行了transfection,但是没有出现Band。
所以我又疑惑把Maxi prep提取的DNA切了一遍,insert这次根本切不掉了。
这到底是什么问题啊。。
不可能是在培养过程中变异或者在freezer里面变异了吧。。。
求解啊~~上面的图是1ug cutting,下面的是2ug...
关于Cloning的问题,求救啊~~
colony cutting(下面的Band).jpg


关于Cloning的问题,求救啊~~-1
stock cutting(下数第二个band).jpg
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

哎   竟然没看懂   我勒个去
2楼2014-02-21 21:32:54
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我勒个也去,看不懂!
3楼2014-02-21 22:16:36
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

下班前匆匆看了下,没看懂
5楼2014-02-22 11:29:53
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意孤城_

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
seo.d_park: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢~确认甲基化以后需要怎么解决啊?重新做么? 2014-02-23 14:19:48
没切位点部分甲基化了
6楼2014-02-22 15:30:08
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
seo.d_park: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢~我再测序试试。 2014-02-23 14:20:43
是不是你存错colony了,再一个重新提一下质粒,用新酶再切一次。若解决不了就测序看看发生了什么。
hehe
7楼2014-02-22 19:44:28
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
seo.d_park: 金币+4, ★★★★★最佳答案, 嗯~谢谢!我重新做试试。 2014-02-23 14:21:32
推测楼主是保存了一个甘油菌(stock)。然后用stock重新活化,发现与原来结果有出入(digestion, expression)。个人意见,要是这样的话,何不重新做一遍(转化)?挑斑->检测。
活着就要让人感受到你的存在。
9楼2014-02-22 22:22:42
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普通回帖

cs2951819

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
seo.d_park: 金币+2 2014-02-23 14:18:45
楼主表达有点难懂,弱弱问一句,你的意思是不是做完克隆表达的菌提你转入的片段,片段提取不出来?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-02-22 08:53:12
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

嗯..
     没看懂+1
Let God do with it as He wills
8楼2014-02-22 19:56:12
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seo.d_park

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鬼羽帝魂 at 2014-02-21 21:32:54
哎   竟然没看懂   我勒个去

貌似我写的太啰嗦了...就是做maxi 提取后,本来表现的蛋白质,不表现了……
10楼2014-02-23 14:15:33
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