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求助：运行了gromacs，想查看体系的总原子数和水分子数！ 已有3人参与
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4楼2014-02-20 08:26:23
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-02-19 11:05:35
moye1991: 金币+2, ★★★很有帮助, 好的，谢谢！ 2014-02-19 11:13:01
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moye1991: 金币+2, ★★★很有帮助, 好的，谢谢！ 2014-02-19 11:13:01
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几个问题，先问问你： 1、在你运行gromacs之前，你是怎么建立你模拟体系的坐标文件的(.pdb 或者.gro 文件)？ 2、gromacs手册，有没有先看看呢？ 3、传说中的 VMD 听说过吗？搜搜论坛里和VMD官网的资料学习一下吧，这个软件对于MD学习非常重要。 问题解答：总原子数在你模拟之前，肯定会知道的啊，看看你的坐标文件，就知道了。水分子个数在你的 .top 文件里有啊。 所以，先好好看看手册，这些问题就不是问题了。 |
2楼2014-02-19 10:13:45
3楼2014-02-19 21:32:53
5楼2014-02-21 10:08:38