24小时热门版块排行榜    

查看: 1641  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

moye1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:运行了gromacs,想查看体系的总原子数和水分子数! 已有3人参与

新手求指点:运行了gromacs,想查看体系的总原子数和水分子数,要怎么做呢,求师兄师姐指点,感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

870277182

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-20 08:22:59
moye1991: 金币+3, ★★★很有帮助, 恩恩,好的,我试试! 2014-02-21 10:08:22
tail -20 topol.top
这个命令就行了
3楼2014-02-19 21:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导! 2014-02-19 11:05:35
moye1991: 金币+2, ★★★很有帮助, 好的,谢谢! 2014-02-19 11:13:01
几个问题,先问问你:
1、在你运行gromacs之前,你是怎么建立你模拟体系的坐标文件的(.pdb 或者.gro 文件)?
2、gromacs手册,有没有先看看呢?
3、传说中的 VMD  听说过吗?搜搜论坛里和VMD官网的资料学习一下吧,这个软件对于MD学习非常重要。

问题解答:总原子数在你模拟之前,肯定会知道的啊,看看你的坐标文件,就知道了。水分子个数在你的 .top 文件里有啊。
所以,先好好看看手册,这些问题就不是问题了。
2楼2014-02-19 10:13:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

彬哥

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-20 11:05:38
可以把文件用写字板打开看一下!
4楼2014-02-20 08:26:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

moye1991

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 彬哥 at 2014-02-20 08:26:23
可以把文件用写字板打开看一下!

好的!
5楼2014-02-21 10:08:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +6 yuleib84 2026-08-19 7/350 2026-08-21 09:24 by zxg7980
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 让我中一个面上吧! +9 大萍1987 2026-08-20 11/550 2026-08-21 08:19 by littlezl
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +22 yaoyewhu2008 2026-08-20 24/1200 2026-08-21 07:44 by DanielDDDD
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见