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haiyanqian

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[求助] 如何计算RMSD值已有1人参与

请问一下大家：
为了判断对接的可靠性，有蛋白结晶的可以抽取出原来的配体再去对接，然后比较两个结果，计算他们的RMSD值。我想请问一下，在sybylX2.0中，如何计算得到这个RMSD值呢？

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1楼 2014-01-13 15:18:00

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hongxiaoyu

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
haiyanqian: 金币+5, ★有帮助 2014-01-15 15:01:02

similarity在一定程度上反应了RMSD值，小于0.8对接的结果就非常好了..

如果非要计算RMSD的话，在Application----Align Compounds-----Match 中可以一个个的比较

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