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很安静007

新虫 (初入文坛)

[交流] 微生物液氮冻融法DNA提取 已有3人参与

用的方法为2.细胞破碎:取 1 管菌体沉淀用 600μl 细胞裂解液充分悬浮,然后在液氮30s和 65℃水浴30s中反复冻融 5 次,37℃水浴 10min ;加 30μl 溶菌酶(50mg/mL),加入 30μlSDS 溶液(10%),37℃水浴 30min ;为什么提出的条带是这样子的。
微生物液氮冻融法DNA提取
总DNA条带
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三蛰

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不用进行抽提吗?
我不会!
2楼2014-01-08 22:42:04
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很安静007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 三蛰 at 2014-01-08 22:42:04
不用进行抽提吗?

具体步骤是这样子的:1.样品处理:5 g豆豉样品加入45 mL灭过菌的生理盐水,振荡30 min,取5 mL溶液置于10
mL离心管中, 400 r/min,离心10 min去沉淀, 8 000rpm/min离心10 min,去上清,菌体用无菌PBS洗3遍后转入2 mL离心管。

2.细胞破碎:取 1 管菌体沉淀用 600μl 细胞裂解液充分悬浮,然后在液氮30s和 65℃水浴30s中反复冻融 5 次,37℃水浴 10min ;加 30μl 溶菌酶(50mg/mL),加入 30μlSDS 溶液(10%),37℃水浴 30min ;

3.提取纯化:随后加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),抽提2次,于冰上放置 5min,12000rpm 离心 5min,氯仿:异戊醇(24:1)抽提,于冰上放置 5min,12000rpm 离心 5min,将上清液转移到新的无菌离心管中,直至上清液清澈透明,最后将上清液转入 1.5mL EP 管中;
4.沉淀收集DNA:加入0.8体积的异丙醇,1/10 体积的乙酸钠,轻轻混匀,于-20℃沉淀 30min;12000rpm,离心 5min,弃上清,加入 1mL 预冷的 70% 乙醇,洗涤两次,12000rpm,离心 5min,弃上清后室温自然风干,加入 30μl  ddH2O,使 DNA 溶解。
试剂配制:
1. 细胞裂解液: 细胞裂解液:CTAB 10-50g/L; NaCl 1.0mol/L; EDTA 50mmol/L; Tris 250mmol/L;
用稀盐酸调节 pH 至 8.0。
2. 溶菌酶(50mg/mL)
3. 氯仿:异戊醇(24:1)
4.异丙醇
5. 乙酸钠
6. 70% 乙醇
7. SDS 溶液(10%)
3楼2014-01-09 09:03:17
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wangweijian

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+1 2014-01-09 17:18:14
你提的是菌体的DNA,是豆豉中的菌体吧,怎么没有Marker,这样就无法判断是胶的问题还是提得不好,不过感觉提出来东西不纯,菌体量少,可能混有豆豉的DNA
4楼2014-01-09 12:09:21
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很安静007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangweijian at 2014-01-09 12:09:21
你提的是菌体的DNA,是豆豉中的菌体吧,怎么没有Marker,这样就无法判断是胶的问题还是提得不好,不过感觉提出来东西不纯,菌体量少,可能混有豆豉的DNA

MARKer跑的条带挺好的就是细菌条带是这样子的不知道是为什么。本以为液氮法挺好的。
5楼2014-01-10 10:00:07
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wangweijian

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 很安静007 at 2014-01-10 10:00:07
MARKer跑的条带挺好的就是细菌条带是这样子的不知道是为什么。本以为液氮法挺好的。...

可以试一下细菌基因组试剂盒,有时候提出的基因组电泳条带不好,但是不影响做PCR
6楼2014-01-10 16:38:03
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 很安静007 at 2014-01-09 09:03:17
具体步骤是这样子的:1.样品处理:5 g豆豉样品加入45 mL灭过菌的生理盐水,振荡30 min,取5 mL溶液置于10
mL离心管中, 400 r/min,离心10 min去沉淀, 8 000rpm/min离心10 min,去上清,菌体用无菌PBS洗3遍后转入2 mL离 ...

第一个 和第二个可以用 后面2个就算了
生命不息奋斗不止
7楼2014-01-11 12:44:26
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

我们以前提取了豆豉中细菌的额DNA,后面的PCR有的受 运气不好的话
生命不息奋斗不止
8楼2014-01-11 12:45:27
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很安静007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冷雁孤旅 at 2014-01-11 12:44:26
第一个 和第二个可以用 后面2个就算了...

那我试一下,谢谢!
9楼2014-01-12 12:24:54
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