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三蛰

铜虫 (小有名气)

[求助] 酵母基因敲除,PCR验证遇到的问题。 已有4人参与

这是我的PCR验证酵母基因敲除(方法就是常用的同源重组法,醋酸锂转化)泳道1出现的是从pUG6扩增disruption cassette 的一对引物,2-5泳道是A-B,6-9泳道是C-D,10-13泳道是A-D,(其中A、D是目的基因两侧的引物,B、C是目的基因内部的引物,B-M、C-M是marker内部的引物)不过,A、B-M和C-M、D并没有条带,所有样品都是用酵母菌液(冻融处理)作为模版。
我的问题是,我的A-D条带大小说明目的基因还在,且A-B,C-D的条带也说明了这点,但是为什么我的泳道1还有大小与我的disruption cassette 相同的条带呢?而且我今天做了个disruptionF,B-M和C-M,disruptionR两对引物,都有大小与预期相同的条带。说明disruption cassette 已经在酵母细胞中了。。。没有发生同源重组?
各位分析一下什么情况……
酵母基因敲除,PCR验证遇到的问题。
yeast2 编辑.jpg
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我不会!
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猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


三蛰(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励交流 2014-03-02 10:58:33
我也是遇到同样的问题,转化后的酵母在抗性板上张得很欢快,可是PCR验证就是不对,我判断是发生了非同源交换,情况和你的很像。
不知道你现在情况如何了?我现在是想多做几次看看能不能成,我的同源部分各有700BP,我觉得发生非同源的概率太不可思议了,文献中的报道都是差不多的做法……感觉做起来特别无力……共勉吧……希望你成功(PS。我现在想再扩大同源的部分,不知道能不能成。)
10楼2014-02-26 22:23:49
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三蛰

铜虫 (小有名气)

不要沉掉……………………
我不会!
2楼2014-01-07 23:17:40
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三蛰

铜虫 (小有名气)

不要沉掉……千万!有做过的望不吝赐教。。。
我不会!
3楼2014-01-08 09:52:09
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spirit87

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-10 23:23:21
三蛰: 金币+2, 有帮助 2014-01-12 21:47:39
你想过没有酵母也会存在二倍体的问题,如果只敲出了一份基因,而另外一份存在的话就这样。我们经常遇到类似情况
4楼2014-01-10 19:57:57
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