24小时热门版块排行榜    

查看: 1249  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

嘟嘟哒

金虫 (小有名气)

[求助] 求助一个蛋白结构模拟方面的问题 已有6人参与

实验需要,我设计了一段氨基酸序列,想预测它所表达的蛋白结构,不知道分子模拟软件能否预测,如果可以,有没有什么简单易操作的软件,毕竟在这方面是外行。谢谢,谢谢,非常感谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

3115321

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-31 16:31:49
嘟嘟哒(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流! 2014-05-31 20:45:28
同源建模,swissmodel先搜索,在建模,都自动化的。要是你水平高也可以用些别的更学术的
4楼2013-12-29 18:11:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-31 16:31:39
嘟嘟哒(月只蓝代发): 金币+3, 鼓励交流! 2014-05-31 20:45:15
同学你好你是想模拟由氨基酸组装为蛋白质的过程?这是有难度的。单纯的计算发的paper就不低。你要从一个一维结构到三级甚至四级结构是一个分子动力学的过程。这个首先得有服务器来算。PC是不可能的。另外你得有正版软件。比如DS。这个计算没有个几百个核是很难跑的。所以你得先做评估。当然本研究室具备这样的计算能力和水平。所以如果能共同通讯合作发paper可以帮你算。你可以先考虑一下。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-12-28 00:37:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iovvoi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2013-12-31 16:31:45
嘟嘟哒(月只蓝代发): 金币+3, 鼓励交流! 2014-05-31 20:45:20
学术软件MODELLER,学术软件只是一段程序代码,你懂得,操作绝对不简易

商业软件DS Modeler ,图形化界面,只需输入序列,马上出来结构。商业软件,你懂得,需要钱的。
3楼2013-12-28 12:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ningll10

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2014-01-03 17:07:57
嘟嘟哒(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流! 2014-05-31 20:45:36
用副本交换的分子动力学模拟,进行充分的 构象搜索,聚类出主流构象,不过不太好做,需要的计算量很大,如果是fast folding的蛋白还好,如果蛋白本身折叠比较慢的话,模拟的时间尺度就是个问题。
5楼2014-01-03 15:45:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 13:23 by xiangy672
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:14 by l0VvVHGBGRLv
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 12:13 by l0VvVHGBGRLv
[考博] 找导师 +5 yuanjiabao 2026-08-29 6/300 2026-08-30 11:52 by zhouyanli11
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:07 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 17/850 2026-08-30 10:28 by 孤独的英雄6
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:39 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 06:11 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 06:10 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:48 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:45 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:34 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
信息提示
请填处理意见