| 查看: 2448 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
Voland金虫 (小有名气)
|
[求助]
MS的力场文件函数如何调用
|
||
|
大家好，我最近在工作中有一个问题，想请教一下各位，希望大家能不吝赐教。 是这样的，之前我有注意过力场文件的修改，常用方法是在.off力场中进行修改，然后再在MS中调用力场文件并使用。对于键接作用，主要是键长项+键角项+二面角项。每一个项都有自己的函数公式，对于键长项，是谐振子模型，即是0.5*k*(r-r')^0.5，那么，如果说我觉得这个函数还不够精确，需要再进行调整，比方说再在谐振子模型上追加微扰项（就像MPn系列的计算一样），那么就需要修改这个函数。请问，如何修改呢？ 我已经在MS的文件夹中搜索过了一遍，包括力场文件我也都看过了，比方说Dreiding力场，.off文件并没有任何定义函数的地方，而函数的描述也只是一句Harmonics，Theta-Harmonics、Dihedral这样的东西，Amber力场要特别一点有这个表达式，但是我不相信就只是一句类似描述的话就可以在力场中定义了一个函数。因此，我相信，这些函数的定义，应该是在软件中的，至少不是在力场中定义的，而力场中的这些句子只起到了调用的作用。如果是这样，那么MS的内部函数定义文件在哪里？ 还希望大家能告之。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子模拟 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
煤层气» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有7人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Towhee能模拟气体吸附等温线吗？
已经有10人回复
- 经典分子动力学力场、势函数
已经有9人回复
- 分子力场中非键能
已经有4人回复
- 关于MS力场编辑
已经有11人回复
- 使用amber力场，一些参数无法获得
已经有5人回复
- MS中sorption模块使用自定义力场出现的问题
已经有26人回复
- NPT系综动力学
已经有19人回复
- MS 进行溶液分子动力学计算时在哪里设置力场参数
已经有5人回复
- 用MS建模导入LAMMPS计算，是不是不能用compass力场？
已经有9人回复
- 使用COMPASS 力场的同学请注意
已经有7人回复
- Coarse - graining 模型中Lennard - Jones 势能函数的指数是怎么调整的？
已经有9人回复
- 关于势函数的求助
已经有23人回复
- 请教关于materials studio建模和OPLS力场
已经有7人回复
- 在LAMMPS中怎么建立图示的模型
已经有6人回复
- ms计算径向分布函数G(r) 怎么不出现负值，如何设置
已经有6人回复
- 用tinker的amoeba09力场模拟~~总是提示参数未定义~~~怎么办啊~热切求助
已经有7人回复
- 【求助】MS中的CVFF力场应用范围如何
已经有7人回复
- 【求助】ms中如何假如势函数，比如EAM，比如自己修改过的势函数。
已经有12人回复
- 【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
Voland
金虫 (小有名气)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 1102.6
- 红花: 9
- 帖子: 167
- 在线: 74.2小时
- 虫号: 2124041
- 注册: 2012-11-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2013-12-10 00:20:41
jerkwin
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +14 - 应助: 454 (硕士)
- 金币: 20659.1
- 散金: 148
- 红花: 81
- 帖子: 813
- 在线: 2648.7小时
- 虫号: 1023452
- 注册: 2010-05-19
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2013-12-09 22:57:49
jerkwin
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +14 - 应助: 454 (硕士)
- 金币: 20659.1
- 散金: 148
- 红花: 81
- 帖子: 813
- 在线: 2648.7小时
- 虫号: 1023452
- 注册: 2010-05-19
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
4楼2013-12-10 02:19:38
Voland
金虫 (小有名气)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 1102.6
- 红花: 9
- 帖子: 167
- 在线: 74.2小时
- 虫号: 2124041
- 注册: 2012-11-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2013-12-10 13:05:27
