24小时热门版块排行榜    

查看: 2092  |  回复: 5

Voland

金虫 (小有名气)

[求助] MS的力场文件函数如何调用

大家好,我最近在工作中有一个问题,想请教一下各位,希望大家能不吝赐教。
是这样的,之前我有注意过力场文件的修改,常用方法是在.off力场中进行修改,然后再在MS中调用力场文件并使用。对于键接作用,主要是键长项+键角项+二面角项。每一个项都有自己的函数公式,对于键长项,是谐振子模型,即是0.5*k*(r-r')^0.5,那么,如果说我觉得这个函数还不够精确,需要再进行调整,比方说再在谐振子模型上追加微扰项(就像MPn系列的计算一样),那么就需要修改这个函数。请问,如何修改呢?
我已经在MS的文件夹中搜索过了一遍,包括力场文件我也都看过了,比方说Dreiding力场,.off文件并没有任何定义函数的地方,而函数的描述也只是一句Harmonics,Theta-Harmonics、Dihedral这样的东西,Amber力场要特别一点有这个表达式,但是我不相信就只是一句类似描述的话就可以在力场中定义了一个函数。因此,我相信,这些函数的定义,应该是在软件中的,至少不是在力场中定义的,而力场中的这些句子只起到了调用的作用。如果是这样,那么MS的内部函数定义文件在哪里?
还希望大家能告之。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子模拟

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Yağma!Yağma!Yağma!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-10 08:47:44
Voland: 金币+5, 有帮助 2013-12-10 13:06:26
Voland: 金币+10 2014-05-06 15:28:14
这要看力场支持不支持你需要的那种形式
若是不支持, 你就不要想了
一般力场的函数形式是由代码决定的
2楼2013-12-09 22:57:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Voland

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-09 22:57:49
这要看力场支持不支持你需要的那种形式
若是不支持, 你就不要想了
一般力场的函数形式是由代码决定的

力场文件不带有函数格式,然后的确是代码决定的,那么,这个代码在哪个文件里面呢?
Yağma!Yağma!Yağma!
3楼2013-12-10 00:20:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Voland at 2013-12-10 00:20:41
力场文件不带有函数格式,然后的确是代码决定的,那么,这个代码在哪个文件里面呢?...

源代码只有软件公司有啊
不是你能看到的
4楼2013-12-10 02:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Voland

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-10 02:19:38
源代码只有软件公司有啊
不是你能看到的...

好吧,先多谢了
Yağma!Yağma!Yağma!
5楼2013-12-10 13:05:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

煤层气

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
冒昧的问一下。你的.off文件是如何打开和修改的,非常感谢
6楼2018-04-20 09:16:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Voland 的主题更新
信息提示
请填处理意见