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Voland金虫 (小有名气)
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MS的力场文件函数如何调用
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大家好,我最近在工作中有一个问题,想请教一下各位,希望大家能不吝赐教。 是这样的,之前我有注意过力场文件的修改,常用方法是在.off力场中进行修改,然后再在MS中调用力场文件并使用。对于键接作用,主要是键长项+键角项+二面角项。每一个项都有自己的函数公式,对于键长项,是谐振子模型,即是0.5*k*(r-r')^0.5,那么,如果说我觉得这个函数还不够精确,需要再进行调整,比方说再在谐振子模型上追加微扰项(就像MPn系列的计算一样),那么就需要修改这个函数。请问,如何修改呢? 我已经在MS的文件夹中搜索过了一遍,包括力场文件我也都看过了,比方说Dreiding力场,.off文件并没有任何定义函数的地方,而函数的描述也只是一句Harmonics,Theta-Harmonics、Dihedral这样的东西,Amber力场要特别一点有这个表达式,但是我不相信就只是一句类似描述的话就可以在力场中定义了一个函数。因此,我相信,这些函数的定义,应该是在软件中的,至少不是在力场中定义的,而力场中的这些句子只起到了调用的作用。如果是这样,那么MS的内部函数定义文件在哪里? 还希望大家能告之。 |
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