| 查看: 2209 | 回复: 6 | ||
[求助]
构建系统发育树出现的问题
|
| 我现在有若干个新种，每个新种在数据库16S序列比对后与其相似度最靠前的十几株菌构建N-J树，可结果发现相似度排第一的菌与我的菌在树上相距很远。为什么会出现这种情况呢？希望各位虫友帮忙 |
回复此楼» 猜你喜欢
材料与化工304求B区调剂
已经有7人回复
-
0703化学336分求调剂
已经有4人回复
-
[复试调剂]西南科技大学国防/材料导师推荐
已经有6人回复
-
化学工程321分求调剂
已经有12人回复
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习
已经有4人回复
-
材料专硕326求调剂
已经有5人回复
-
东南大学364求调剂
已经有5人回复
-
国自科面上基金字体
已经有7人回复
-
药学383 求调剂
已经有4人回复
-
286求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 26s rDNA系统发育树的构建
已经有7人回复
- 系统发育树的建立和分析
已经有15人回复
- 霉菌18SrDNA鉴定，构建发育树的问题
已经有6人回复
- 系统发育树构建
已经有31人回复
- 系统发育树求教，不知道自己做的这个树有没有什么问题
已经有13人回复
- 构建系统发育树时，最后发表使用哪棵树？如何使用结果
已经有5人回复
- 系统发育树中的bootstrap怎么调整？
已经有7人回复
- 关于构建系统发育树的问题，小白求教？为什么变形菌门老是不在一个分支
已经有10人回复
- 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的
已经有15人回复
- 有没有谁知道如何构建系统发育树呀？
已经有8人回复
- 基于氨基酸的系统发育树的构建
已经有6人回复
- MEGA 5.0构建系统发育树的问题
已经有10人回复
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 【求助/交流】如何构建系统更发育树
已经有16人回复
- 请教：系统发育树怎么做？
已经有14人回复
20093651
铁杆木虫 (职业作家)
- MicEPI: 2
- 应助: 212 (大学生)
- 金币: 5307.4
- 散金: 3276
- 红花: 63
- 沙发: 2
- 帖子: 3731
- 在线: 656.6小时
- 虫号: 1176129
- 注册: 2010-12-23
- 专业: 金属材料表面科学与工程
2楼2013-12-07 22:02:01
3楼2013-12-08 10:22:27
20093651
铁杆木虫 (职业作家)
- MicEPI: 2
- 应助: 212 (大学生)
- 金币: 5307.4
- 散金: 3276
- 红花: 63
- 沙发: 2
- 帖子: 3731
- 在线: 656.6小时
- 虫号: 1176129
- 注册: 2010-12-23
- 专业: 金属材料表面科学与工程
4楼2013-12-08 12:47:26
hkqgeoffrey
金虫 (小有名气)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 1351.4
- 散金: 3
- 红花: 2
- 帖子: 135
- 在线: 45.4小时
- 虫号: 2546967
- 注册: 2013-07-15
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
雨后泥巴: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-12-09 16:54:52
laozuzunzhe: 金币+3, good！ 2014-03-21 22:36:53
感谢参与，应助指数 +1
雨后泥巴: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-12-09 16:54:52
laozuzunzhe: 金币+3, good！ 2014-03-21 22:36:53
同源性高并不代表进化关系近，同源性只是从序列相似角度分析，但是在每一个位置的序列所代表的的意义，以及几个基因密码连在一起的作用都是同源性无法分析的，进化树是采用特殊的计算方法，从转录-翻译角度解释进化水平相似性，所以不能靠单一一项工作完成分析。 当然16S是当前比较流行的鉴定方法，其到属的准确性确实毋庸置疑，但由于基因异型性等多方面问题，通过16S到种的鉴定还是值得怀疑，不过用以参考和减小工作量还不错 |
5楼2013-12-09 10:23:40
竹子小小
木虫 (小有名气)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 1567.2
- 散金: 160
- 红花: 4
- 帖子: 200
- 在线: 157.3小时
- 虫号: 1972495
- 注册: 2012-09-04
- 专业: 微生物资源与分类学
6楼2013-12-10 14:22:22
7楼2014-03-21 21:07:00
