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细菌基因组分析——COGs如何分类？
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最近在做一个细菌的基因组分析，里面需要对预测的蛋白做COGs分类。 上网查了下，主要是在NCBI上做的。 据说下了数据库之后本地blast可以做到批量处理 所以去FTP下了数据库，下了localblast程序，可是完全不知道如何下手啊。 求生信大神来个深入浅出的教程。 还有以前帖子上写的单独蛋白的COG分类（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html）已经被NCBI关了。 在新的NCBI COG页面上完全不提供单个比对，so该如何做单个比对呢？ 跪谢啊！！ ps：我只用localblast 做过基因序列的批量处理，是网上查了代码，用perl做了个脚本做的。 |
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nanhu1984
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