| 查看: 1284 | 回复: 1 | ||
[求助]
细菌基因组分析——COGs如何分类？
|
|
最近在做一个细菌的基因组分析，里面需要对预测的蛋白做COGs分类。 上网查了下，主要是在NCBI上做的。 据说下了数据库之后本地blast可以做到批量处理 所以去FTP下了数据库，下了localblast程序，可是完全不知道如何下手啊。 求生信大神来个深入浅出的教程。 还有以前帖子上写的单独蛋白的COG分类（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html）已经被NCBI关了。 在新的NCBI COG页面上完全不提供单个比对，so该如何做单个比对呢？ 跪谢啊！！ ps：我只用localblast 做过基因序列的批量处理，是网上查了代码，用perl做了个脚本做的。 |
回复此楼» 猜你喜欢
321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二
已经有8人回复
-
成果系统访问量大，请15分钟后再尝试。由此给您造成的不便，敬请谅解。
已经有7人回复
-
295求调剂。一志愿报考郑州大学化学工艺学硕，总分295分
已经有9人回复
-
求调剂
已经有4人回复
-
289求调剂
已经有4人回复
-
268求调剂
已经有10人回复
-
085602化学工程350，调剂，有没有211的
已经有5人回复
-
0856调剂
已经有9人回复
-
290分材料工程085601求调剂 数二英一
已经有6人回复
-
接收调剂
已经有14人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 细菌基因组中为什么会有多个16srDNA片段？
已经有11人回复
- 谁买过细菌基因组DNA大量提取的试剂盒？（最好一次能提取50ml菌液的）
已经有4人回复
- 水体细菌基因组总DNA的提取
已经有6人回复
- 细菌全基因组测序
已经有5人回复
- 提取细菌基因组DNA时总是会有蛋白残留
已经有10人回复
- 总是提不出来细菌基因组DNA
已经有11人回复
- 提取细菌基因组DNA
已经有9人回复
- 求助细菌基因组组装
已经有18人回复
- 细菌基因组文库构建的相关问题
已经有23人回复
- 细菌基因组的部分酶切
已经有16人回复
- 细菌基因组DNA电泳图谱
已经有6人回复
- 细菌基因组DNA提取 交流
已经有18人回复
- 细菌全基因组提取时需要加入RNA酶吗？
已经有15人回复
- EcoRI 酶切细菌基因组切不开
已经有19人回复
- 有什么方法把外源DNA插入到细菌的基因组上
已经有13人回复
- 细菌全基因组提取求助
已经有7人回复
- 细菌基因组DNA的纯化方法？
已经有5人回复
- 【求助/交流】提取细菌基因组DNA的试剂盒
已经有8人回复
- 【求助/交流】如何构建细菌的基因组表达文库
已经有19人回复
- 【求助/交流】新菌鉴定 细菌基因组 GC 含量 哪里可以测？急急急急急急。。谢谢谢谢
已经有8人回复
- 【求助/交流】细菌基因组DNA的提取法（CTAB/NaCl 法）,提取的DNA是否为细菌总DNA? 非�
已经有11人回复
- 【求助/交流】关于细菌基因组DNA大小的问题
已经有9人回复
nanhu1984
银虫 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 2251.2
- 散金: 13
- 红花: 13
- 帖子: 701
- 在线: 245.4小时
- 虫号: 2531775
- 注册: 2013-07-04
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
2楼2014-01-03 22:56:52
